More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0949 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.54 
 
 
1039 aa  684    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  38.91 
 
 
1023 aa  744    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  41.62 
 
 
1039 aa  764    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  37.3 
 
 
1031 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 
1053 aa  2100    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.76 
 
 
1039 aa  679    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.19 
 
 
1049 aa  688    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.85 
 
 
1066 aa  754    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  38.9 
 
 
1071 aa  770    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  40.14 
 
 
1066 aa  757    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  39.65 
 
 
1043 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  41.34 
 
 
1030 aa  661    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  37.67 
 
 
1039 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.09 
 
 
1048 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  39.58 
 
 
1036 aa  716    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.06 
 
 
1049 aa  681    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  39.86 
 
 
1034 aa  721    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  38.74 
 
 
1047 aa  684    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  41 
 
 
1041 aa  740    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  42.23 
 
 
1045 aa  804    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.92 
 
 
1037 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.55 
 
 
1039 aa  682    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.54 
 
 
1039 aa  684    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.25 
 
 
1037 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.71 
 
 
1049 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  35.86 
 
 
1052 aa  636    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.75 
 
 
1092 aa  749    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  38.61 
 
 
1039 aa  679    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  38.77 
 
 
1047 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.13 
 
 
1026 aa  711    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.21 
 
 
1034 aa  734    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  39.28 
 
 
1043 aa  685    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  58.45 
 
 
1061 aa  1244    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.43 
 
 
1048 aa  661    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  38.51 
 
 
1075 aa  638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 
1040 aa  650    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  38.22 
 
 
1039 aa  675    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  37.21 
 
 
1052 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  38.62 
 
 
1043 aa  661    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  86.46 
 
 
1054 aa  1786    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.61 
 
 
1039 aa  679    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  38.68 
 
 
1049 aa  670    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  37.24 
 
 
1058 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  37.75 
 
 
1058 aa  623  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  37.43 
 
 
1066 aa  619  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  36.5 
 
 
1032 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  35.96 
 
 
1039 aa  601  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  35.22 
 
 
1069 aa  594  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  36.34 
 
 
1075 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  33.52 
 
 
1065 aa  593  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  36.28 
 
 
1070 aa  592  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  35.93 
 
 
1082 aa  592  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  36.15 
 
 
1070 aa  592  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  36.24 
 
 
1075 aa  586  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  36.18 
 
 
1070 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  36.17 
 
 
1054 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  33.78 
 
 
1064 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  35.5 
 
 
1076 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  36.05 
 
 
1068 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  35.38 
 
 
1072 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  36.24 
 
 
1068 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  34.94 
 
 
1066 aa  582  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  36.24 
 
 
1068 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  35.08 
 
 
1076 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3791  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.14 
 
 
1068 aa  579  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  35.06 
 
 
1064 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  35.61 
 
 
1077 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  34.5 
 
 
1069 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  34.55 
 
 
1070 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  35.19 
 
 
1062 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  34.57 
 
 
1070 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.04 
 
 
1034 aa  572  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  34.57 
 
 
1070 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.04 
 
 
1066 aa  572  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  34.57 
 
 
1070 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  34.17 
 
 
1074 aa  567  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  33.68 
 
 
1075 aa  568  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  35.12 
 
 
1066 aa  567  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  34.45 
 
 
1070 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.27 
 
 
1443 aa  567  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  34.95 
 
 
1077 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  34.95 
 
 
1077 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  34.95 
 
 
1077 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  34.95 
 
 
1077 aa  562  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  34.95 
 
 
1077 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  33.46 
 
 
1043 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  34.95 
 
 
1077 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 
1054 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  34.86 
 
 
1077 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  33.37 
 
 
1029 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  34.73 
 
 
1077 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  33.74 
 
 
1083 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  34.43 
 
 
1070 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.05 
 
 
1459 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  33.91 
 
 
1034 aa  555  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  36.3 
 
 
1064 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 
1064 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  34.41 
 
 
1040 aa  555  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  34.63 
 
 
1060 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  33.12 
 
 
1063 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>