More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0905 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0905  TrkA-N domain protein  100 
 
 
225 aa  457  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1067  hypothetical protein  81.78 
 
 
225 aa  390  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  80.44 
 
 
227 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4814  TrkA-N domain protein  69.2 
 
 
226 aa  317  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2667  TrkA-N domain protein  70.09 
 
 
230 aa  316  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3449  TrkA-N domain protein  70.09 
 
 
230 aa  316  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  61.99 
 
 
237 aa  294  8e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.65 
 
 
221 aa  91.7  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.65 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.65 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  26.03 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 
221 aa  88.2  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  26.42 
 
 
225 aa  85.5  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  27.8 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0087  potassium transporter peripheral membrane component  24.42 
 
 
466 aa  82.8  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  24.77 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  24.76 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  25.24 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  24.52 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  30 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  30.5 
 
 
617 aa  79  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.03 
 
 
443 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  23.98 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  29.15 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 
484 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  28.37 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 
484 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4070  potassium transporter peripheral membrane component  26.84 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000101925 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  24.17 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  23.11 
 
 
449 aa  72.4  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  28.51 
 
 
452 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3673  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 
444 aa  72  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  22.27 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  24.89 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  26.41 
 
 
485 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  25.12 
 
 
445 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  29.03 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  27.1 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  27.1 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  27.1 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  29.68 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  27.59 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  30.77 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  23.72 
 
 
445 aa  68.6  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  25.22 
 
 
457 aa  68.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  27.11 
 
 
450 aa  68.2  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  25.94 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2218  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000230921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  25 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0890  TrkA-C domain protein  23.56 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220881  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3473  TrkA-N domain protein  25.68 
 
 
442 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  28.98 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  23.98 
 
 
465 aa  67  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.27 
 
 
458 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  22.97 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  25.73 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  28.98 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  26.27 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.48 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  25.54 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  23.83 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  40.4 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  26.64 
 
 
458 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  23.39 
 
 
449 aa  65.5  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  24.58 
 
 
350 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  26.17 
 
 
458 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  24.44 
 
 
469 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  23.18 
 
 
444 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  24.54 
 
 
457 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 
469 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 
458 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4544  potassium transporter peripheral membrane component  27.27 
 
 
492 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  24.58 
 
 
350 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  26.17 
 
 
458 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  21.4 
 
 
465 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  24.46 
 
 
458 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  26.17 
 
 
458 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  25.81 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  22.17 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  26.76 
 
 
477 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  23.48 
 
 
351 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  20.44 
 
 
449 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  26.89 
 
 
455 aa  63.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  24.46 
 
 
458 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  26.19 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  24.07 
 
 
444 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  29.17 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  26.15 
 
 
458 aa  63.9  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 
458 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  24 
 
 
469 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  24 
 
 
469 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  25.7 
 
 
458 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  29.08 
 
 
454 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>