29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0867 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  100 
 
 		 89 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  67.53 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5124  photosystem I reaction center subunit PsaK  57.3 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0293041  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  57.3 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  62.34 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  63.64 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  56.58 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  63.64 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  54.22 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  52.87 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  60.53 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0301  photosystem I PsaK protein (subunit X)  48.75 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.332819  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09731  photosystem I PsaK protein (subunit X)  48.75 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.438982 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  48.72 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09531  photosystem I PsaK protein (subunit X)  45.98 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.437179  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  48.31 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15351  photosystem I PsaK protein (subunit X)  45.24 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  43.68 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  47.19 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0894  photosystem I PsaK protein (subunit X)  48.72 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  44.09 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  46.59 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  51.32 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0741  photosystem I reaction center subunit PsaK  53.52 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167381  normal  0.0747979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  41.57 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2540  photosystem I reaction center subunit X-like protein  39.13 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3379  photosystem I reaction center subunit PsaK  40.23 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000107099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  42.86 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3380  photosystem I reaction center subunit PsaK  36.26 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000108124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>