More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0864 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  67.35 
 
 		 991 aa  1409    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1060 aa  2149    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  54.63 
 
 		 828 aa  804    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  44.66 
 
 		 782 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  38.94 
 
 		 985 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.27 
 
 		 1009 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  34.66 
 
 		 1266 aa  343  8e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 		 1313 aa  338  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  29.52 
 
 		 957 aa  335  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  32.56 
 
 		 809 aa  324  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  35.35 
 
 		 2145 aa  290  1e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  46.77 
 
 		 412 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.3 
 
 		 1162 aa  264  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1162 aa  260  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 1450 aa  249  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 949 aa  247  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  40.56 
 
 		 340 aa  243  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  32.36 
 
 		 1238 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.77 
 
 		 1186 aa  235  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  36.98 
 
 		 1550 aa  234  8.000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.4 
 
 		 1328 aa  233  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  41.16 
 
 		 343 aa  232  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  30 
 
 		 941 aa  227  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  29.87 
 
 		 725 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 1215 aa  218  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 2741 aa  210  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 1101 aa  204  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 923 aa  203  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.97 
 
 		 2741 aa  201  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 1261 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  28.43 
 
 		 1914 aa  194  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1404 aa  181  8e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.94 
 
 		 1279 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  36.97 
 
 		 408 aa  178  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 1063 aa  177  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 868 aa  172  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  27.88 
 
 		 740 aa  164  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1714 aa  164  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 		 1025 aa  163  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 636 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.63 
 
 		 854 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.8 
 
 		 919 aa  161  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 916 aa  155  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.91 
 
 		 609 aa  152  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  33.61 
 
 		 689 aa  152  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  29.3 
 
 		 694 aa  151  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1526 aa  151  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 851 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.05 
 
 		 1288 aa  149  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1596 aa  148  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  29.64 
 
 		 950 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 454 aa  147  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 438 aa  147  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 1054 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  29.49 
 
 		 708 aa  141  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  32.24 
 
 		 825 aa  138  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  27.85 
 
 		 2327 aa  137  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.87 
 
 		 1507 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1212 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 		 1040 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  27.39 
 
 		 1020 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  28.07 
 
 		 853 aa  132  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  24.27 
 
 		 717 aa  132  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 905 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 905 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.48 
 
 		 1291 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.05 
 
 		 968 aa  128  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  29.29 
 
 		 493 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 796 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  26.64 
 
 		 840 aa  127  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  27.76 
 
 		 755 aa  127  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 760 aa  127  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  26.67 
 
 		 1054 aa  126  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.44 
 
 		 852 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 649 aa  125  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  21.76 
 
 		 893 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  33.87 
 
 		 1228 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 1048 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  27.99 
 
 		 845 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  23.13 
 
 		 891 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  25.82 
 
 		 364 aa  122  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 883 aa  121  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.96 
 
 		 732 aa  121  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  27.08 
 
 		 1147 aa  121  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  27.62 
 
 		 1021 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 729 aa  120  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  26.52 
 
 		 725 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  27.55 
 
 		 836 aa  119  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  26.08 
 
 		 944 aa  118  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  25.5 
 
 		 960 aa  118  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  21.34 
 
 		 1180 aa  118  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 994 aa  118  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  22.75 
 
 		 1611 aa  117  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 714 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.52 
 
 		 904 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 659 aa  115  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  27.4 
 
 		 1025 aa  115  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 843 aa  114  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 639 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1676 aa  114  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>