More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0844 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
249 aa  516  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  84.34 
 
 
249 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  83.94 
 
 
249 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  75.9 
 
 
249 aa  401  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  73.49 
 
 
249 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  72.69 
 
 
249 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  73.14 
 
 
248 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  70.56 
 
 
251 aa  368  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.85 
 
 
246 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.18 
 
 
260 aa  311  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.76 
 
 
260 aa  302  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.44 
 
 
256 aa  299  3e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.18 
 
 
265 aa  298  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.44 
 
 
256 aa  298  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.83 
 
 
266 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.55 
 
 
259 aa  293  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.45 
 
 
267 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  53.62 
 
 
245 aa  280  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.04 
 
 
267 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  53.97 
 
 
256 aa  278  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
267 aa  272  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  52.34 
 
 
247 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  53.97 
 
 
264 aa  269  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.65 
 
 
267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  52.36 
 
 
257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
266 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.89 
 
 
267 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
276 aa  261  8.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  52.07 
 
 
259 aa  260  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.93 
 
 
247 aa  260  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.13 
 
 
249 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  47.7 
 
 
246 aa  258  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.27 
 
 
251 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
263 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
253 aa  256  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.71 
 
 
256 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.09 
 
 
258 aa  256  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.79 
 
 
249 aa  255  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  52.36 
 
 
252 aa  255  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.56 
 
 
259 aa  255  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
276 aa  255  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
240 aa  255  6e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.64 
 
 
241 aa  254  8e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.51 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  46.75 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
258 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.69 
 
 
282 aa  253  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  48.31 
 
 
248 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.93 
 
 
249 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
246 aa  251  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.93 
 
 
282 aa  251  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88710  predicted protein  46.85 
 
 
273 aa  251  8.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0116194  decreased coverage  0.00230003 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.78 
 
 
285 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
272 aa  249  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.5 
 
 
252 aa  249  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  51.5 
 
 
244 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.06 
 
 
256 aa  249  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
238 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  52.17 
 
 
251 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.48 
 
 
246 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  53.3 
 
 
253 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
232 aa  249  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.95 
 
 
258 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.94 
 
 
246 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  48.72 
 
 
254 aa  248  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.15 
 
 
258 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.15 
 
 
258 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.15 
 
 
258 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.15 
 
 
258 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.15 
 
 
258 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.15 
 
 
258 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
273 aa  247  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.15 
 
 
258 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  47.33 
 
 
264 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.72 
 
 
249 aa  247  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
251 aa  245  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.26 
 
 
252 aa  245  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.34 
 
 
258 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.34 
 
 
257 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
254 aa  244  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  48.96 
 
 
256 aa  244  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.76 
 
 
256 aa  244  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  47.7 
 
 
240 aa  244  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
238 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  49.21 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  46.47 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  43.82 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.11 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2972  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.906819 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
252 aa  242  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
238 aa  242  5e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
252 aa  242  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>