112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0793 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 551 aa  1117    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  58.85 
 
 		 645 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  58.33 
 
 		 632 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  44.14 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  45.68 
 
 		 593 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  45.23 
 
 		 591 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  44.2 
 
 		 586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  44.2 
 
 		 586 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  42.17 
 
 		 639 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  43.05 
 
 		 641 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  41.65 
 
 		 581 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  41.65 
 
 		 581 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  42.49 
 
 		 529 aa  361  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  40.07 
 
 		 550 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  37.67 
 
 		 581 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  38.48 
 
 		 666 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  38.48 
 
 		 666 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  38.42 
 
 		 533 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  38.04 
 
 		 563 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  36.15 
 
 		 574 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  37.97 
 
 		 572 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  35.24 
 
 		 542 aa  313  4.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  39.84 
 
 		 491 aa  313  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  38.49 
 
 		 561 aa  307  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  39.33 
 
 		 622 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  36.38 
 
 		 550 aa  306  8.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  37.69 
 
 		 530 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  36.52 
 
 		 604 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  34.26 
 
 		 539 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  34.35 
 
 		 658 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  33.99 
 
 		 508 aa  278  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  34.38 
 
 		 589 aa  273  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  33.77 
 
 		 600 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  33.52 
 
 		 624 aa  249  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  33.51 
 
 		 571 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  34.18 
 
 		 531 aa  238  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  33.45 
 
 		 543 aa  237  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  34.99 
 
 		 548 aa  237  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  34.32 
 
 		 518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  33.6 
 
 		 606 aa  227  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  33.88 
 
 		 578 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  32.36 
 
 		 643 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  34.53 
 
 		 629 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  32.69 
 
 		 510 aa  206  7e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  33.07 
 
 		 513 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  30.08 
 
 		 568 aa  200  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  32.94 
 
 		 500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  31.38 
 
 		 543 aa  193  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  32.66 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  30.64 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  31.14 
 
 		 524 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  31.46 
 
 		 528 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  29.95 
 
 		 561 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  43.64 
 
 		 514 aa  171  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  29.86 
 
 		 518 aa  163  9e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  40.47 
 
 		 475 aa  160  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  26.74 
 
 		 544 aa  138  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  42.62 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  52.89 
 
 		 188 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  25.45 
 
 		 515 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  46.56 
 
 		 262 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  46.56 
 
 		 262 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  71.64 
 
 		 261 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  25.5 
 
 		 515 aa  100  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  31.14 
 
 		 450 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  29.76 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  31.07 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  37.37 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  38.1 
 
 		 946 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  23.79 
 
 		 390 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  37.38 
 
 		 932 aa  70.1  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  32.26 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  24.7 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  30.06 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  24.86 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  25 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  31.16 
 
 		 432 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  37.5 
 
 		 919 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  25.92 
 
 		 384 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  35.25 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  33.01 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  34.75 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  28.36 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  37.5 
 
 		 361 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  33.33 
 
 		 335 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  27.54 
 
 		 432 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  35.04 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.48 
 
 		 673 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  41.94 
 
 		 1821 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  41.67 
 
 		 343 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  39.58 
 
 		 424 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  26.9 
 
 		 784 aa  51.6  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  36.36 
 
 		 333 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  31.06 
 
 		 336 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  34.71 
 
 		 332 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  45.45 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  46.67 
 
 		 1036 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  32.08 
 
 		 694 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  54.76 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  25.97 
 
 		 400 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>