More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0767 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  100 
 
 
404 aa  835    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  63.22 
 
 
395 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  63.22 
 
 
395 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  55.67 
 
 
415 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  57.14 
 
 
392 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  53.18 
 
 
401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  47.14 
 
 
387 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  41.65 
 
 
400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  38.89 
 
 
428 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  38.87 
 
 
391 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  39.64 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  37.72 
 
 
400 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  37.47 
 
 
400 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  34.1 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  34.7 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  33.59 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  34.1 
 
 
391 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  32.04 
 
 
367 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  29.4 
 
 
372 aa  170  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  30.03 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  29.66 
 
 
379 aa  155  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  31.19 
 
 
287 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  24.63 
 
 
403 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  28.21 
 
 
381 aa  143  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  25.84 
 
 
393 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  26.3 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  28.95 
 
 
430 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  26.51 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  26.51 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  25.98 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.75 
 
 
412 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.56 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  24.35 
 
 
381 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  27.01 
 
 
430 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  26.44 
 
 
414 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  29.43 
 
 
383 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.83 
 
 
406 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  26.65 
 
 
393 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25.32 
 
 
401 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  26.51 
 
 
462 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  25.97 
 
 
416 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.29 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.52 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  26.05 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.93 
 
 
418 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.19 
 
 
425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.97 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.85 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.67 
 
 
418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  27.29 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  24.76 
 
 
476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  24.57 
 
 
407 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.8 
 
 
414 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.99 
 
 
414 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  24.06 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  24.69 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  30.2 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.92 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.94 
 
 
413 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  25.74 
 
 
393 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.16 
 
 
406 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.42 
 
 
407 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.33 
 
 
413 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.24 
 
 
414 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  24.05 
 
 
469 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.54 
 
 
414 aa  116  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  26.53 
 
 
414 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 
413 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  26.01 
 
 
461 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  26.67 
 
 
437 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  26.95 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  27.75 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  23.82 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  23.54 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.7 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.74 
 
 
413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  27.46 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.15 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.2 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  28.14 
 
 
455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.98 
 
 
410 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  26.8 
 
 
377 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.8 
 
 
413 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.8 
 
 
413 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.03 
 
 
417 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  29.43 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.28 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.09 
 
 
428 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.07 
 
 
414 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.76 
 
 
414 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  24.88 
 
 
422 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.12 
 
 
406 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  28.24 
 
 
380 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  25.54 
 
 
880 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  27.09 
 
 
399 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.92 
 
 
438 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.63 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  25.42 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.21 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.7 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>