39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0696 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  65.29 
 
 
907 aa  1140    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  65.07 
 
 
902 aa  1174    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  61.63 
 
 
900 aa  1072    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 
862 aa  1799    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  42.26 
 
 
813 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  40.24 
 
 
811 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  44.29 
 
 
811 aa  623  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  40.05 
 
 
817 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  38.83 
 
 
820 aa  619  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  40 
 
 
812 aa  613  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  44.02 
 
 
811 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  40.07 
 
 
807 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  39.34 
 
 
807 aa  602  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  39.33 
 
 
814 aa  602  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  40.23 
 
 
823 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  38.33 
 
 
814 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  43.14 
 
 
794 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  40.36 
 
 
816 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 
850 aa  566  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  40.85 
 
 
812 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  40.26 
 
 
812 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  35.23 
 
 
786 aa  524  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  37.22 
 
 
871 aa  522  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  44.27 
 
 
791 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  34.96 
 
 
790 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  41.32 
 
 
709 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  38.56 
 
 
766 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  39.35 
 
 
779 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  39.62 
 
 
821 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  39.35 
 
 
771 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  36.13 
 
 
682 aa  269  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  34.87 
 
 
472 aa  247  6e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  33.89 
 
 
485 aa  245  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  34.39 
 
 
471 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 
485 aa  242  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 
1162 aa  48.9  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 
722 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0294  hypothetical protein  27.34 
 
 
524 aa  45.4  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1370  4-alpha-glucanotransferase  21.05 
 
 
677 aa  45.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>