More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0674 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1021 aa  2097    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.71 
 
 
759 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.13 
 
 
1344 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.08 
 
 
935 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.07 
 
 
703 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.57 
 
 
1122 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.42 
 
 
714 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.16 
 
 
630 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.6 
 
 
634 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.28 
 
 
1418 aa  557  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.66 
 
 
838 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.85 
 
 
1081 aa  539  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.4 
 
 
873 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 
1432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.08 
 
 
576 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.9 
 
 
1070 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.7 
 
 
1070 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.02 
 
 
654 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
1428 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.66 
 
 
647 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
1222 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.3 
 
 
989 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.06 
 
 
682 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 
760 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 
926 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 
712 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
1255 aa  361  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
859 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
622 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
853 aa  300  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
822 aa  292  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
1260 aa  292  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
1260 aa  288  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  33.82 
 
 
844 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
1322 aa  282  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
1808 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
1279 aa  275  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
803 aa  274  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
1113 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
962 aa  267  8e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
770 aa  265  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 
1509 aa  265  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
1106 aa  263  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
557 aa  263  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
1108 aa  263  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
645 aa  261  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
776 aa  260  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
936 aa  259  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 
789 aa  258  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
770 aa  257  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
661 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 
782 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 
651 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 
677 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 
796 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
819 aa  255  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
802 aa  254  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 
642 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
758 aa  253  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
874 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
897 aa  252  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 
1714 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
983 aa  252  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
888 aa  251  4e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 
673 aa  251  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
880 aa  251  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 
743 aa  250  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 
1548 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1132 aa  250  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 
849 aa  249  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
781 aa  249  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
845 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
802 aa  248  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  28.71 
 
 
1109 aa  248  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  37.17 
 
 
654 aa  247  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.59 
 
 
916 aa  247  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
810 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
796 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  37.6 
 
 
527 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
711 aa  247  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  35.71 
 
 
945 aa  246  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
850 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 
929 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
991 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
953 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 
926 aa  245  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
857 aa  244  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 
789 aa  243  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 
789 aa  243  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 
807 aa  243  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
785 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
853 aa  243  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
981 aa  243  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  35.47 
 
 
945 aa  242  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  34.11 
 
 
892 aa  241  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
639 aa  241  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
912 aa  241  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
522 aa  241  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  35.86 
 
 
525 aa  241  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
736 aa  241  8e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>