More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0550 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  67.28 
 
 		 224 aa  311  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  67.28 
 
 		 224 aa  310  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  61.93 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  61.47 
 
 		 226 aa  282  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  61.01 
 
 		 222 aa  276  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  58.56 
 
 		 228 aa  250  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  52.78 
 
 		 221 aa  218  7.999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  42.58 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  45.16 
 
 		 225 aa  167  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  42.4 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  41.15 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  39.55 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  44.29 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  41.74 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  40.95 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  41.94 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  39.91 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  38.33 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  42.17 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  42.31 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  42.4 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  39.55 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  39.04 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  41.55 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  40.89 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  42.93 
 
 		 235 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  44.12 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  43.06 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41.87 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  39.45 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  40.18 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.87 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  44.13 
 
 		 190 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  40.5 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  41.26 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  38.12 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  41.87 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  41.67 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  39.45 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  39.17 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  37.12 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  39.6 
 
 		 239 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  36.68 
 
 		 230 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 		 237 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  36.82 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  42.42 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  39.8 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  38.91 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  39.22 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  37.68 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  38.5 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  36.65 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  35.37 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  39.5 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  38.31 
 
 		 235 aa  141  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.72 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  38.31 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  38.86 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.31 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  36.45 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  37.13 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  37.13 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  37.93 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  39.64 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  40.36 
 
 		 239 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  39.13 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  36.45 
 
 		 231 aa  138  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  38 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  38 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  39.22 
 
 		 232 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  38.29 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  36.99 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  39.19 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  38.5 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  39.13 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  35.62 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  35 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  33.63 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  38.12 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  38.12 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  38.12 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  36.14 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  39.13 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  38.12 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  36.07 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  38.61 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  36.56 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.12 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  33.93 
 
 		 253 aa  135  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.92 
 
 		 276 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  36.89 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  39.02 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  37.89 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  39.8 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>