More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0488 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.96 
 
 
267 aa  297  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.3 
 
 
277 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
327 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
332 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
330 aa  168  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
330 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 
269 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
240 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
248 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
248 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  36.07 
 
 
544 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 
244 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  43.52 
 
 
269 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
264 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  31.37 
 
 
295 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
258 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
278 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
252 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  38.26 
 
 
245 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
249 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
246 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  31.37 
 
 
295 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
328 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
328 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
264 aa  150  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
334 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
247 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  34.27 
 
 
236 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
239 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 
253 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
336 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
260 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  36.52 
 
 
255 aa  149  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
266 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
336 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
249 aa  149  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
336 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
244 aa  148  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
248 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
317 aa  148  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
442 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 
239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
334 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
441 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.91 
 
 
250 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.91 
 
 
250 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.11 
 
 
245 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 
441 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
244 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
255 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
334 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
244 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
441 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
244 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
279 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
244 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
244 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
272 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.47 
 
 
239 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
286 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
336 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
245 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
332 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
246 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.836966 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.07 
 
 
246 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
278 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
249 aa  141  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
355 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.59 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>