More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0459 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0459  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
114 aa  234  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  58.33 
 
 
129 aa  133  6e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1747  thioredoxin-related  55.56 
 
 
128 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  54.46 
 
 
112 aa  130  7e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  54.46 
 
 
112 aa  130  7e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0149  thioredoxin domain-containing protein  52.78 
 
 
128 aa  128  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.55638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  45.13 
 
 
115 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  48.04 
 
 
111 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  39.39 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  42.11 
 
 
107 aa  88.6  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  37.14 
 
 
109 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  38.1 
 
 
116 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  36.89 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  38.1 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  37.86 
 
 
109 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  37.86 
 
 
109 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  37.86 
 
 
109 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  38.38 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  39.81 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  35.24 
 
 
112 aa  84.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  43.96 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  35.92 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  36 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  35.71 
 
 
107 aa  84.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  38.54 
 
 
109 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.1281e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  35.51 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  38.89 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  43.62 
 
 
105 aa  83.6  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  35.64 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  33.03 
 
 
125 aa  83.6  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  36 
 
 
112 aa  82.8  1e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  36.73 
 
 
107 aa  82.8  1e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  35.64 
 
 
107 aa  82.8  1e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  9.46631e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  34.91 
 
 
107 aa  82.8  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  35.64 
 
 
120 aa  83.2  1e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  44.19 
 
 
108 aa  83.2  1e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  36.73 
 
 
107 aa  82.4  2e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  32 
 
 
109 aa  82.4  2e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  41.05 
 
 
110 aa  82.4  2e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.31883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  41.76 
 
 
107 aa  82.4  2e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  2.65159e-07 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  34.91 
 
 
124 aa  82.4  2e-15  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  34.91 
 
 
107 aa  82  3e-15  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  37.5 
 
 
111 aa  81.6  3e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  39.56 
 
 
108 aa  81.3  4e-15  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  35.85 
 
 
106 aa  81.3  4e-15  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  38.2 
 
 
107 aa  81.3  4e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  44.32 
 
 
165 aa  81.3  4e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  35.85 
 
 
106 aa  81.3  4e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  42.16 
 
 
111 aa  80.9  5e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  38.89 
 
 
108 aa  80.9  6e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  34.95 
 
 
108 aa  80.9  6e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  37.14 
 
 
123 aa  80.9  6e-15  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  36.89 
 
 
113 aa  80.9  6e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  34.69 
 
 
107 aa  80.1  8e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  32.08 
 
 
106 aa  80.5  8e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  34.69 
 
 
107 aa  80.1  8e-15  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  34.69 
 
 
107 aa  80.1  8e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  34.69 
 
 
107 aa  80.1  1e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  34 
 
 
110 aa  79.7  1e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  34.69 
 
 
107 aa  79.7  1e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  38.04 
 
 
108 aa  79.7  1e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  43.37 
 
 
108 aa  79.3  1e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  39.33 
 
 
110 aa  79.7  1e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  37.8 
 
 
107 aa  79  2e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  7.62931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  36.78 
 
 
148 aa  79  2e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  31.43 
 
 
113 aa  79  2e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  40.74 
 
 
108 aa  79  2e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  36.46 
 
 
105 aa  78.6  2e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  29.13 
 
 
110 aa  79  2e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  29.91 
 
 
107 aa  79  2e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  33.02 
 
 
107 aa  79.3  2e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  33.02 
 
 
107 aa  79.3  2e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  37.8 
 
 
107 aa  78.2  3e-14  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.30429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  42.17 
 
 
107 aa  78.6  3e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  36.63 
 
 
106 aa  78.6  3e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  41.38 
 
 
108 aa  78.6  3e-14  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  37 
 
 
119 aa  78.2  3e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  36.08 
 
 
109 aa  78.2  3e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  30.63 
 
 
154 aa  78.6  3e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  34.65 
 
 
107 aa  78.6  3e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  37 
 
 
106 aa  78.2  3e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  35.29 
 
 
104 aa  77.8  4e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  33.98 
 
 
110 aa  77.8  4e-14  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1247  thioredoxin  32.38 
 
 
113 aa  77.8  5e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000845354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  37.25 
 
 
107 aa  77.4  5e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  34 
 
 
106 aa  77.8  5e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  33.65 
 
 
106 aa  77.4  6e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  32.29 
 
 
108 aa  77.4  6e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  33 
 
 
106 aa  77  7e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  32.63 
 
 
108 aa  77  8e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  31.43 
 
 
109 aa  77  8e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  32.38 
 
 
105 aa  77  9e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  31.96 
 
 
108 aa  76.6  9e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  30.43 
 
 
105 aa  77  9e-14  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  35.19 
 
 
108 aa  77  9e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  5.61264e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  39.18 
 
 
105 aa  77  9e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  31.68 
 
 
109 aa  76.6  9e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  33.65 
 
 
287 aa  76.3  1e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  37 
 
 
105 aa  76.6  1e-13  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>