More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0351 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
336 aa  698    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  83.04 
 
 
336 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  83.04 
 
 
336 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.4 
 
 
335 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.22 
 
 
339 aa  557  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.61 
 
 
355 aa  553  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.03 
 
 
337 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.38 
 
 
335 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.54 
 
 
337 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.06 
 
 
337 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.07 
 
 
337 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 
337 aa  454  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 
337 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 
337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.56 
 
 
338 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 
338 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 
338 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  60.29 
 
 
342 aa  419  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 
347 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  56.21 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
336 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
348 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
345 aa  337  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
339 aa  335  9e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 
327 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 
328 aa  332  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
332 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
339 aa  329  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
334 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
344 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
354 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
344 aa  325  7e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 
350 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 
350 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
348 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
344 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
328 aa  322  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
336 aa  322  4e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
347 aa  322  8e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
327 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
353 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
353 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
353 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
365 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
355 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  48 
 
 
355 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
334 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
338 aa  315  8e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
334 aa  315  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 
331 aa  315  9e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
346 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
346 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
346 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
345 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
355 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
355 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
330 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
354 aa  308  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
329 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
334 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
334 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
334 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
334 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
334 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
354 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  46.59 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>