57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0336 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  1006    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  61.59 
 
 		 493 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  61.59 
 
 		 493 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  49.79 
 
 		 512 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  46.68 
 
 		 494 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  47.65 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  42.75 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  41.27 
 
 		 480 aa  360  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  29.76 
 
 		 502 aa  204  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  30.91 
 
 		 535 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  29.37 
 
 		 491 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  26.71 
 
 		 490 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  25.75 
 
 		 483 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  26.19 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1118 aa  170  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  27.13 
 
 		 472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  26.08 
 
 		 472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  28.15 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  29.09 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  26.44 
 
 		 495 aa  134  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1126 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  30.18 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1116 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  26.64 
 
 		 1198 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  27.06 
 
 		 1082 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  26.01 
 
 		 1153 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  29.12 
 
 		 390 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1172 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  26.08 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  26.08 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3875  RecB family-like nuclease  24.15 
 
 		 499 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00135732  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  23.06 
 
 		 1228 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.07 
 
 		 1250 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  25.36 
 
 		 1280 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  25.86 
 
 		 366 aa  91.3  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  27.91 
 
 		 1163 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1215 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  24.12 
 
 		 1151 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  23.6 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1215 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  21.49 
 
 		 1121 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  24 
 
 		 1350 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  27.7 
 
 		 1143 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  27.7 
 
 		 1143 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  27.7 
 
 		 1143 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1139 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  24.45 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1247 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  20.63 
 
 		 1270 aa  73.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00680  predicted nuclease (RecB family)  23.58 
 
 		 545 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  24.22 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.1 
 
 		 1324 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  24.04 
 
 		 1196 aa  63.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  20.86 
 
 		 1175 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  29.85 
 
 		 1255 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  24.41 
 
 		 576 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0119  RecB family nuclease, putative  23.89 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>