99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0296 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 97 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  53.61 
 
 		 97 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  38.95 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  41.84 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  32.99 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  37.76 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  37.76 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  34.04 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  30.11 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  27.96 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  26.26 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  31.18 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  31.03 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  36.45 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  31.18 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  32.26 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  28.87 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  28.75 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  26.88 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  37.78 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  32.94 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  30.43 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  32 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  23.71 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  26.14 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  31.08 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  31.08 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  30.21 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  26.97 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  32.98 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  26.53 
 
 		 100 aa  47.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  32.63 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  30.93 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  30.85 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  21.05 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  33.7 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  27.55 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  29.87 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  24.68 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  30.11 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  27.4 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  29.81 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  27.91 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  27.42 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  32.53 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  30.26 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  31.08 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  28.17 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  32.67 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  31.08 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  23.71 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  29.87 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  34.85 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  25.51 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  28.85 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  26.53 
 
 		 103 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  31.88 
 
 		 69 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  27.12 
 
 		 76 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  23.46 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  26.14 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  28.21 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  27.16 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  30.59 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  29.82 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  27.37 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  23.4 
 
 		 106 aa  40  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>