More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0247 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.49 
 
 
476 aa  817    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.26 
 
 
475 aa  747    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.53 
 
 
479 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
478 aa  976    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.48 
 
 
476 aa  723    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.63 
 
 
477 aa  717    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  72 
 
 
476 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.91 
 
 
476 aa  818    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.05 
 
 
489 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.75 
 
 
480 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.75 
 
 
480 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.66 
 
 
480 aa  589  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.95 
 
 
480 aa  584  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.16 
 
 
481 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.39 
 
 
479 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.75 
 
 
479 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.54 
 
 
479 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.32 
 
 
479 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  58.04 
 
 
543 aa  550  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  57.79 
 
 
462 aa  526  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.2 
 
 
458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.67 
 
 
465 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 
475 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.89 
 
 
463 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.65 
 
 
465 aa  292  8e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.55 
 
 
470 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 
478 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 
470 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.91 
 
 
458 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.34 
 
 
462 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.12 
 
 
462 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.06 
 
 
467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.23 
 
 
593 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.82 
 
 
478 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 
470 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 
470 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 
470 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 
470 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 
470 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 
470 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.03 
 
 
478 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.87 
 
 
467 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 
470 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 
470 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 
470 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 
467 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.87 
 
 
467 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.82 
 
 
478 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.91 
 
 
462 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.26 
 
 
466 aa  279  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.81 
 
 
470 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
470 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.5 
 
 
470 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.82 
 
 
478 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 
478 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.48 
 
 
467 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.24 
 
 
468 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  36.19 
 
 
478 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.12 
 
 
474 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
470 aa  277  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.05 
 
 
478 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
468 aa  277  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.98 
 
 
478 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.9 
 
 
468 aa  276  6e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.45 
 
 
474 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 
476 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 
476 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 
476 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.85 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.46 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 
478 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.82 
 
 
476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 
478 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.94 
 
 
467 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.94 
 
 
465 aa  273  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.16 
 
 
476 aa  273  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.19 
 
 
478 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.08 
 
 
466 aa  273  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.98 
 
 
477 aa  273  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.58 
 
 
470 aa  273  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.97 
 
 
476 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.97 
 
 
476 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.97 
 
 
476 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.63 
 
 
459 aa  272  9e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 
478 aa  272  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.97 
 
 
476 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 
462 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.95 
 
 
476 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.77 
 
 
464 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.73 
 
 
469 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.14 
 
 
466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 
471 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.38 
 
 
471 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.73 
 
 
461 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.54 
 
 
476 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.54 
 
 
476 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.74 
 
 
476 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.31 
 
 
476 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.82 
 
 
461 aa  269  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>