28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0228 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0228  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  337  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2172  hypothetical protein  52.63 
 
 		 400 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.103435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  39.02 
 
 		 805 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2416  hypothetical protein  50.88 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3005  E1-E2 ATPase-associated domain protein  43.33 
 
 		 628 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3953  hypothetical protein  44.64 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.162282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  40.26 
 
 		 737 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5066  hypothetical protein  37.66 
 
 		 385 aa  57.4  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0931999  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2568  hypothetical protein  46.3 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.9304  normal  0.567584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3546  hypothetical protein  46.3 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  48.15 
 
 		 819 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  40.85 
 
 		 743 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0225  hypothetical protein  44.83 
 
 		 370 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.780759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0214  Cation transport ATPase-like protein  40.35 
 
 		 526 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3362  hypothetical protein  36.11 
 
 		 404 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2077  hypothetical protein  31.58 
 
 		 210 aa  50.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 723 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5065  hypothetical protein  32.89 
 
 		 235 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0222136  normal  0.603351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2725  hypothetical protein  37.74 
 
 		 380 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  hitchhiker  0.00312453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  33.78 
 
 		 755 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1569  hypothetical protein  30.51 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592347  decreased coverage  0.00826206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  26.98 
 
 		 703 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2990  hypothetical protein  46.77 
 
 		 371 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22660  hypothetical protein  35.21 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155306  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  42.31 
 
 		 716 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4692  hypothetical protein  35.85 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.73111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  48.21 
 
 		 770 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 		 766 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>