More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0186 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
209 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  76.33 
 
 
212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  76.33 
 
 
212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  61.27 
 
 
209 aa  255  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  60.77 
 
 
209 aa  253  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  58.37 
 
 
227 aa  248  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  57.43 
 
 
208 aa  234  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  39.9 
 
 
199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.16 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  40.2 
 
 
205 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  37.69 
 
 
213 aa  121  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  37.88 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  37.88 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  43.29 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  36.87 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  37.23 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  37.56 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  35.86 
 
 
355 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.76 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.67 
 
 
457 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.66 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  35.33 
 
 
200 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  43.84 
 
 
245 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  33.13 
 
 
202 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.84 
 
 
203 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  29.44 
 
 
201 aa  101  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  36.49 
 
 
202 aa  98.2  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  32 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  34.72 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  33.12 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  38.46 
 
 
199 aa  94.7  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  32.78 
 
 
222 aa  94.7  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  30.37 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  40.29 
 
 
172 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  30.48 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  32.95 
 
 
216 aa  92  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  31.76 
 
 
213 aa  92  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  31.66 
 
 
220 aa  92  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  30.48 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  30.39 
 
 
202 aa  91.7  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  28.43 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  28.43 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  28.43 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  31.68 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  28.43 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  32.5 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  29.63 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  36.42 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  27.94 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  32.52 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  32.07 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  30.57 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  29.63 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  37.67 
 
 
172 aa  89.4  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  30.38 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.72 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  34.78 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  28.65 
 
 
210 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  32.65 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  32.65 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  29.56 
 
 
224 aa  88.2  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  29.35 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
222 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.58 
 
 
521 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  31.18 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.29 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  30.81 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  28.49 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  26.26 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0536  alkaline phosphatase  27.51 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.95 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  31.25 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  32.39 
 
 
245 aa  85.1  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.26 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  30.52 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  30.24 
 
 
237 aa  84.7  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  36.03 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  28.87 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  28.18 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  30.77 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  30.13 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  29.1 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.32 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  32.4 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  35.2 
 
 
236 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1057  alkaline phosphatase  31.25 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000034861  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  30.18 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  27.46 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  32.28 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  32.91 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  31.09 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  29.55 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  29.81 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>