19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0157 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0157  CpcD phycobilisome linker domain protein  100 
 
 
79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00508163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3078  CpcD phycobilisome linker domain protein  76.32 
 
 
78 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3042  CpcD phycobilisome linker domain protein  75.64 
 
 
78 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1051  phycocyanin linker protein 9K  58.97 
 
 
81 aa  100  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240621 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  61.84 
 
 
439 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  56.96 
 
 
440 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3486  CpcD phycobilisome linker domain-containing protein  63.16 
 
 
81 aa  92.8  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  66.67 
 
 
406 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  66.67 
 
 
406 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2933  CpcD phycobilisome linker-like  59.49 
 
 
80 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  53.16 
 
 
403 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1693  CpcD phycobilisome linker domain protein  65.57 
 
 
76 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.268965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  51.95 
 
 
400 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  51.35 
 
 
403 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000202848  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  57.81 
 
 
405 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0581  hypothetical protein  46.77 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0564  hypothetical protein  46.77 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  43.86 
 
 
286 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1761  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.381589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>