More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0079 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  72.61 
 
 
517 aa  719  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  100 
 
 
499 aa  1024  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  72.79 
 
 
479 aa  706  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  72.2 
 
 
509 aa  739  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  72.2 
 
 
509 aa  739  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  64.83 
 
 
590 aa  695  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  62.15 
 
 
494 aa  639  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  42.17 
 
 
491 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  44.35 
 
 
468 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  45.59 
 
 
462 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  46.12 
 
 
479 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  42.67 
 
 
466 aa  365  1e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  43.51 
 
 
466 aa  357  3e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  41.69 
 
 
451 aa  345  1e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  42.12 
 
 
449 aa  339  8e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  41.61 
 
 
444 aa  333  5e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  40.35 
 
 
443 aa  333  6e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  42.44 
 
 
488 aa  330  4e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  40.41 
 
 
444 aa  323  4e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  38.4 
 
 
531 aa  316  7e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  44.02 
 
 
470 aa  312  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  38.53 
 
 
456 aa  300  4e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  39.42 
 
 
451 aa  299  8e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  44.27 
 
 
440 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  37.42 
 
 
451 aa  290  4e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  36.75 
 
 
451 aa  284  3e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  34.2 
 
 
531 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  32.55 
 
 
551 aa  209  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  36.13 
 
 
654 aa  204  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  34.99 
 
 
652 aa  188  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  32.73 
 
 
647 aa  169  9e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  33.1 
 
 
650 aa  167  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  32.2 
 
 
551 aa  153  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  32.23 
 
 
558 aa  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.2 
 
 
550 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  29.76 
 
 
590 aa  150  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.88 
 
 
558 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  30.69 
 
 
548 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  2.73082e-05 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.65 
 
 
555 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 
548 aa  144  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  32.23 
 
 
550 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  30.61 
 
 
551 aa  144  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  30.25 
 
 
666 aa  141  2e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  30.34 
 
 
548 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  29.16 
 
 
549 aa  140  4e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  31.61 
 
 
951 aa  140  4e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  30.95 
 
 
548 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  31.03 
 
 
548 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  29.37 
 
 
558 aa  140  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  31.4 
 
 
548 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  30.91 
 
 
557 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  31.79 
 
 
581 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  31.79 
 
 
559 aa  137  6e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  30.53 
 
 
554 aa  134  4e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  30.65 
 
 
602 aa  134  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  31.03 
 
 
561 aa  133  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.03 
 
 
548 aa  132  1e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  30.26 
 
 
545 aa  132  2e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  29.34 
 
 
658 aa  132  2e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  31.39 
 
 
649 aa  132  2e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  30.08 
 
 
542 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  31.58 
 
 
564 aa  130  5e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  29.93 
 
 
464 aa  130  5e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  30.34 
 
 
555 aa  130  5e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  30.51 
 
 
546 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  31.65 
 
 
630 aa  129  1e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  30.08 
 
 
549 aa  129  1e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  30.08 
 
 
549 aa  129  1e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  30.08 
 
 
549 aa  129  1e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  29.23 
 
 
545 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  29.37 
 
 
549 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  29.47 
 
 
550 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  29.1 
 
 
549 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  28.21 
 
 
485 aa  123  1e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  29.67 
 
 
385 aa  120  5e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  30.69 
 
 
556 aa  120  5e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  27.92 
 
 
485 aa  119  1e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  25.12 
 
 
720 aa  119  2e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  7.7682e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  26.04 
 
 
838 aa  118  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  27.37 
 
 
479 aa  117  4e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  38.04 
 
 
630 aa  117  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  7.32435e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  27.84 
 
 
706 aa  116  8e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  27.23 
 
 
479 aa  116  1e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  27.37 
 
 
479 aa  116  1e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 
479 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  25.78 
 
 
463 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  27.63 
 
 
696 aa  107  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  25.97 
 
 
698 aa  106  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  32.61 
 
 
886 aa  106  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  28.84 
 
 
715 aa  99.8  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  27.15 
 
 
455 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  24.7 
 
 
866 aa  97.8  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  22.74 
 
 
818 aa  97.4  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  21.88 
 
 
781 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  26.15 
 
 
489 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  26.15 
 
 
489 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  25.37 
 
 
493 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  27.49 
 
 
492 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  33.68 
 
 
796 aa  93.6  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  25.37 
 
 
732 aa  93.6  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>