More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0053 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0053  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
109 aa  225  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1540  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.55 
 
 
109 aa  125  1e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1565  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.6 
 
 
109 aa  124  4e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3829  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.56 
 
 
110 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1291  HesB/YadR/YfhF  48.62 
 
 
112 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0112575  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0658  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
110 aa  107  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0472  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0066  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.72 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  43.81 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.37 
 
 
147 aa  94.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.30443e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
120 aa  90.5  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0526  HesB domain-containing protein  39.22 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.255563  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.24 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.24 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.14 
 
 
111 aa  88.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4552  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.38 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.685133  normal  0.324174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  37.74 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  39.81 
 
 
108 aa  88.2  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  38.1 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  38.1 
 
 
117 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  38.1 
 
 
117 aa  87  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  38.1 
 
 
117 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  38.1 
 
 
117 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  38.1 
 
 
130 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
119 aa  87  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  38.1 
 
 
130 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  38.1 
 
 
130 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.96 
 
 
116 aa  86.7  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
117 aa  86.7  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.1 
 
 
117 aa  86.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1456  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0753774  normal  0.435352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  39.45 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  39.62 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  40.57 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  40.57 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0167  hesB/yadR/yfhF family protein  37.14 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  40.57 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3446  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  39.62 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  38.68 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  3.76167e-05 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.1 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  3.35505e-05 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.89 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.89 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.18 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  84.3  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.83 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2084  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15600  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
116 aa  84  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722466  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
121 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  40.19 
 
 
106 aa  84  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
127 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12230  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
130 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.40084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0414  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.79 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  1.49537e-05 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.02 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  6.28621e-07 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  39.62 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  82.8  1e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
122 aa  83.2  1e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
122 aa  83.2  1e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3067  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
124 aa  83.2  1e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2673  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
124 aa  83.2  1e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.407171  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16270  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.1 
 
 
119 aa  82.8  1e-15  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.591813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
122 aa  83.2  1e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
122 aa  83.2  1e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0036  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.32 
 
 
126 aa  83.2  1e-15  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1479  HesB/YadR/YfhF family protein  40.19 
 
 
106 aa  83.2  1e-15  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0188943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>