More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0048 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0048  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 105 aa  214  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1286  30S ribosomal protein S10  96.19 
 
 		 105 aa  210  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00174582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0663  30S ribosomal protein S10  96.19 
 
 		 105 aa  210  7e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0477  30S ribosomal protein S10  95.24 
 
 		 105 aa  208  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0395283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0883  30S ribosomal protein S10  95.24 
 
 		 105 aa  207  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1535  30S ribosomal protein S10  96.19 
 
 		 104 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1560  30S ribosomal protein S10  96.19 
 
 		 104 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0613138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  91.43 
 
 		 105 aa  199  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0319  30S ribosomal protein S10  86.27 
 
 		 106 aa  187  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1599  30S ribosomal protein S10  83.65 
 
 		 106 aa  187  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17101  30S ribosomal protein S10  83.65 
 
 		 106 aa  186  9e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16981  30S ribosomal protein S10  83.65 
 
 		 106 aa  186  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16301  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 106 aa  185  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16871  30S ribosomal protein S10  84.47 
 
 		 106 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1073  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 106 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19481  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 106 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2023  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 106 aa  184  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.532021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23661  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 106 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.09836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  153  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  150  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1339  ribosomal protein S10  64.15 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  147  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  146  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30445  Plastid ribosomal protein S10 small ribosomal subunit  63.27 
 
 		 136 aa  146  9e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.499456  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  66 
 
 		 103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  65 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  66.34 
 
 		 103 aa  144  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 103 aa  143  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  62.75 
 
 		 102 aa  143  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  143  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  64.71 
 
 		 103 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 		 102 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_002620  TC0720  30S ribosomal protein S10  68 
 
 		 105 aa  142  2e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0939005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0561  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  64.76 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 102 aa  140  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  141  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  141  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  140  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  140  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  140  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 102 aa  140  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  67.65 
 
 		 103 aa  140  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  140  7e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  140  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000141431  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  60.78 
 
 		 102 aa  140  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  60.78 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>