More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0046 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  100 
 
 
287 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  63.7 
 
 
288 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  63.7 
 
 
288 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  55.94 
 
 
295 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  6.30901e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  55.89 
 
 
296 aa  322  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  55.16 
 
 
293 aa  320  2e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4418  prephenate dehydratase  55.99 
 
 
284 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  51.6 
 
 
291 aa  285  8e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  42.7 
 
 
359 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  39.18 
 
 
284 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  42.7 
 
 
359 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  43.59 
 
 
280 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  43.43 
 
 
368 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  42.75 
 
 
276 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  42.34 
 
 
358 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  42.09 
 
 
281 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  38.99 
 
 
311 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.24 
 
 
358 aa  192  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  37.63 
 
 
274 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.68391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.78 
 
 
362 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  38.55 
 
 
281 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  40.94 
 
 
276 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  41.3 
 
 
291 aa  184  1e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  43.12 
 
 
304 aa  184  1e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  39.11 
 
 
361 aa  184  1e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  37.25 
 
 
311 aa  182  4e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  40.86 
 
 
360 aa  182  4e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  39.13 
 
 
372 aa  182  4e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  38.93 
 
 
281 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  40.88 
 
 
358 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  39.71 
 
 
283 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  38.99 
 
 
276 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  37.96 
 
 
272 aa  181  9e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.39 
 
 
360 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.34 
 
 
367 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.39 
 
 
360 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.39 
 
 
360 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.03 
 
 
360 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.39 
 
 
360 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.39 
 
 
360 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.39 
 
 
360 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.39 
 
 
360 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  38.57 
 
 
279 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  43.27 
 
 
360 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92693e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.21 
 
 
355 aa  180  3e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  41.88 
 
 
386 aa  179  3e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.7938e-09  hitchhiker  6.00467e-09 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.05 
 
 
373 aa  180  3e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  40.57 
 
 
282 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  40.22 
 
 
365 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  38.57 
 
 
279 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  40.89 
 
 
281 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  39.75 
 
 
281 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  37.45 
 
 
366 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  39.49 
 
 
364 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  41.45 
 
 
359 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  40 
 
 
364 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.77 
 
 
381 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.23 
 
 
371 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  39.86 
 
 
365 aa  174  1e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  39.21 
 
 
286 aa  174  1e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  40 
 
 
364 aa  174  1e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  39.64 
 
 
364 aa  174  1e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  40 
 
 
367 aa  174  1e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  40.22 
 
 
365 aa  174  2e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  36.88 
 
 
280 aa  174  2e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  39.64 
 
 
364 aa  173  3e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  36.63 
 
 
359 aa  172  4e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  38.13 
 
 
286 aa  172  4e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  39.13 
 
 
364 aa  172  8e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.13 
 
 
364 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  38.3 
 
 
279 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.55 
 
 
365 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  37.96 
 
 
552 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  37.46 
 
 
278 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  37.59 
 
 
552 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  38.68 
 
 
278 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  36.1 
 
 
356 aa  168  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  37.59 
 
 
371 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  37.59 
 
 
371 aa  166  3e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  38.32 
 
 
360 aa  166  3e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  38.1 
 
 
360 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  34.86 
 
 
303 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  36.56 
 
 
355 aa  165  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.23 
 
 
371 aa  165  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  38.38 
 
 
366 aa  165  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  38.69 
 
 
373 aa  164  1e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  36.69 
 
 
355 aa  164  2e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 
359 aa  164  2e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  35.86 
 
 
282 aa  164  2e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  35.97 
 
 
374 aa  163  2e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.63 
 
 
357 aa  163  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  32.61 
 
 
277 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  35.97 
 
 
374 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  36.03 
 
 
355 aa  163  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  37.72 
 
 
274 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  35.4 
 
 
418 aa  162  4e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  36.63 
 
 
359 aa  162  5e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  35.82 
 
 
277 aa  162  8e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  32.25 
 
 
277 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  39.19 
 
 
359 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>