More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0043 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  100 
 
 
212 aa  430  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  68.42 
 
 
205 aa  247  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  68.42 
 
 
205 aa  247  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  61.73 
 
 
225 aa  245  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  59.9 
 
 
221 aa  239  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  58.38 
 
 
211 aa  224  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  51.38 
 
 
215 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  51.93 
 
 
207 aa  175  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.19 
 
 
199 aa  166  3e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  48.62 
 
 
196 aa  164  7e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.27 
 
 
208 aa  163  2e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  49.45 
 
 
203 aa  162  4e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  48.37 
 
 
209 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  51.63 
 
 
202 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  49.19 
 
 
240 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  47.8 
 
 
196 aa  158  5e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  47.42 
 
 
198 aa  158  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50 
 
 
198 aa  158  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  2.94513e-05 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50.54 
 
 
240 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  49.73 
 
 
209 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  48.11 
 
 
235 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  49.73 
 
 
209 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  49.46 
 
 
250 aa  156  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  44.75 
 
 
214 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  48.9 
 
 
206 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.38708e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  49.19 
 
 
229 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  48.13 
 
 
201 aa  151  6e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  47.59 
 
 
201 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  45.23 
 
 
211 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  47.28 
 
 
210 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  47.89 
 
 
214 aa  149  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1353  Ribonuclease H  46.96 
 
 
188 aa  149  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  46.99 
 
 
242 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.54 
 
 
204 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  43.28 
 
 
219 aa  148  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  47.57 
 
 
218 aa  148  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  49.74 
 
 
207 aa  148  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  48.17 
 
 
308 aa  148  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  45.23 
 
 
213 aa  147  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  46.77 
 
 
227 aa  147  1e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  45.45 
 
 
198 aa  146  2e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  43.37 
 
 
209 aa  147  2e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  3.58144e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  43.27 
 
 
217 aa  146  3e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  47.59 
 
 
207 aa  145  4e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.28 
 
 
268 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.13775e-09  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  46.24 
 
 
190 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  45.9 
 
 
277 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  40.51 
 
 
272 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  44.57 
 
 
202 aa  145  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  44.57 
 
 
202 aa  145  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  46.74 
 
 
199 aa  144  7e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  47.83 
 
 
203 aa  144  7e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  44.95 
 
 
198 aa  144  7e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  46.52 
 
 
197 aa  144  7e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  45.45 
 
 
208 aa  144  7e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  46.52 
 
 
217 aa  144  8e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  46.07 
 
 
193 aa  144  8e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  44.39 
 
 
214 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  47.03 
 
 
198 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  47.03 
 
 
198 aa  144  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  47.03 
 
 
198 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  40 
 
 
272 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  42.64 
 
 
230 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  43.01 
 
 
198 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  44.32 
 
 
198 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.47482e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  47.57 
 
 
210 aa  143  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  46.74 
 
 
198 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  47.28 
 
 
195 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  45.6 
 
 
197 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  45.5 
 
 
207 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  46.7 
 
 
197 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  42.93 
 
 
249 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  46.52 
 
 
218 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  44.9 
 
 
198 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  46.74 
 
 
195 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  45.6 
 
 
256 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  46.24 
 
 
198 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  44.32 
 
 
212 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  46.24 
 
 
198 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  46.24 
 
 
198 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  44.9 
 
 
198 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  44.67 
 
 
198 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  44.9 
 
 
198 aa  142  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  44.67 
 
 
198 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  44.67 
 
 
198 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.69157e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  41.38 
 
 
209 aa  142  4e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  44.67 
 
 
198 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  48.09 
 
 
206 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  43.65 
 
 
201 aa  142  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  44.67 
 
 
198 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  47.87 
 
 
338 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  45.99 
 
 
207 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  41.58 
 
 
210 aa  142  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  46.52 
 
 
207 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  46.52 
 
 
207 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  42.44 
 
 
229 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  47.25 
 
 
216 aa  141  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  44.62 
 
 
224 aa  140  1e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  44.2 
 
 
208 aa  140  1e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  46.49 
 
 
198 aa  140  1e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>