More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0042 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  63.21 
 
 
682 aa  744  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  76.04 
 
 
713 aa  745  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  66.83 
 
 
687 aa  772  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  6.95712e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 
645 aa  1311  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  72.94 
 
 
653 aa  900  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  67.24 
 
 
669 aa  755  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  76.87 
 
 
808 aa  679  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  72.94 
 
 
653 aa  900  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0313  RNAse E  54.56 
 
 
646 aa  597  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2029  ribonuclease E and G  54.51 
 
 
646 aa  596  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  67.72 
 
 
647 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  54.14 
 
 
640 aa  575  1e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  53.96 
 
 
640 aa  574  1e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16241  ribonuclease E/G  51.05 
 
 
624 aa  572  1e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16811  ribonuclease E/G  48.15 
 
 
608 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  50.89 
 
 
606 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  50.18 
 
 
605 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  45.85 
 
 
602 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  40.7 
 
 
559 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  41.39 
 
 
564 aa  300  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  42.45 
 
 
702 aa  298  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  40.57 
 
 
562 aa  296  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  38.13 
 
 
494 aa  293  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  41.9 
 
 
543 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  43.24 
 
 
496 aa  287  5e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  41.75 
 
 
1007 aa  286  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  41.6 
 
 
908 aa  283  6e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  37.25 
 
 
476 aa  283  6e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  38.48 
 
 
411 aa  283  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.60891e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  40.9 
 
 
571 aa  283  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  40.2 
 
 
1041 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  39.56 
 
 
1093 aa  281  4e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.69273e-08 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  40.36 
 
 
1080 aa  280  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  44 
 
 
416 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.41125e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  40.89 
 
 
990 aa  278  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  38.59 
 
 
1022 aa  276  1e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  38.01 
 
 
483 aa  275  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  40.26 
 
 
1334 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  40.72 
 
 
1427 aa  271  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  40.1 
 
 
1048 aa  269  9e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  38.87 
 
 
1194 aa  269  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  39.18 
 
 
1093 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  39.69 
 
 
1151 aa  268  3e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01232e-13 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  38.33 
 
 
952 aa  267  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1764  ribonuclease  35.29 
 
 
465 aa  267  4e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  40.26 
 
 
1058 aa  267  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  40.15 
 
 
922 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  39.19 
 
 
974 aa  267  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  38.68 
 
 
515 aa  266  7e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  40.15 
 
 
717 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  37.12 
 
 
525 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  39.69 
 
 
1113 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  41.15 
 
 
959 aa  265  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  39.3 
 
 
1123 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  38.83 
 
 
1117 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  39.86 
 
 
1043 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  39.74 
 
 
1024 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  39.8 
 
 
944 aa  264  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  37.97 
 
 
496 aa  264  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  37.97 
 
 
496 aa  264  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  40.56 
 
 
1070 aa  264  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  39.37 
 
 
1040 aa  264  5e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  39.08 
 
 
531 aa  263  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  38.01 
 
 
490 aa  262  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  41.01 
 
 
503 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.58312e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  38.85 
 
 
1265 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  36.57 
 
 
497 aa  261  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2187  ribonuclease E  40.37 
 
 
1068 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.33181  hitchhiker  7.73492e-09 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1297  ribonuclease E  40.37 
 
 
1067 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48033e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1282  ribonuclease E  40.37 
 
 
1068 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783205  hitchhiker  4.8225e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2003  ribonuclease E  40.37 
 
 
1067 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  40.98 
 
 
496 aa  260  5e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1253  ribonuclease E  40.37 
 
 
1067 aa  260  5e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  39.27 
 
 
492 aa  260  5e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  41.39 
 
 
636 aa  260  5e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  40.72 
 
 
496 aa  260  5e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  40.05 
 
 
503 aa  260  5e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.77215e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2516  ribonuclease E  40.11 
 
 
1061 aa  259  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.96842e-05  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01088  hypothetical protein  40.11 
 
 
1061 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00236445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1207  ribonuclease E  40.11 
 
 
1061 aa  259  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.38621e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  38.61 
 
 
1091 aa  259  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01080  fused ribonucleaseE: endoribonuclease/RNA-binding protein/RNA degradosome binding protein  40.11 
 
 
1061 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00444981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2042  ribonuclease E  40.11 
 
 
1057 aa  259  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000184616  hitchhiker  0.00765925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1207  ribonuclease E  40.11 
 
 
1061 aa  259  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.87022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2241  ribonuclease E  40.11 
 
 
1061 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.15068e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2562  ribonuclease, Rne/Rng family  40.11 
 
 
1061 aa  259  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.07422e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  40.16 
 
 
1244 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1463  ribonuclease E  40.11 
 
 
1061 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00215249  hitchhiker  1.03406e-07 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  38.75 
 
 
497 aa  258  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  40.52 
 
 
493 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1600  ribonuclease E  40.11 
 
 
1048 aa  257  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.27165e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  38.5 
 
 
497 aa  256  1e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  36.63 
 
 
489 aa  255  2e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  37.63 
 
 
492 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1579  ribonuclease, Rne/Rng family  39.11 
 
 
1060 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00521114  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  36.17 
 
 
489 aa  254  5e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  36.56 
 
 
489 aa  253  8e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1242  ribonuclease  39.85 
 
 
928 aa  253  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2816  ribonuclease E  38.85 
 
 
1121 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00267025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1898  ribonuclease E  39.11 
 
 
1122 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.46531e-07  hitchhiker  0.000483574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>