21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0039 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0039  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  786  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1947  Sporulation domain protein  48.59 
 
 
362 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1974  Sporulation domain protein  48.59 
 
 
362 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.160258  normal  0.0302087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4065  S-layer domain protein  47.1 
 
 
416 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4104  S-layer domain protein  47.1 
 
 
416 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0683  S-layer domain protein  58.94 
 
 
412 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4842  hypothetical protein  47.42 
 
 
287 aa  196  5e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2943  hypothetical protein  52.23 
 
 
191 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1338  hypothetical protein  51.28 
 
 
260 aa  169  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.193609  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0630  hypothetical protein  41.44 
 
 
380 aa  141  2e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.313978  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2520  hypothetical protein  40.57 
 
 
585 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2272  hypothetical protein  37.04 
 
 
209 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03111  hypothetical protein  38.71 
 
 
247 aa  116  7e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0411  hypothetical protein  33.53 
 
 
196 aa  115  1e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2152  hypothetical protein  34.1 
 
 
262 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2467  hypothetical protein  36.13 
 
 
242 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27821  hypothetical protein  36.13 
 
 
245 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2582  hypothetical protein  38.46 
 
 
626 aa  60.8  3e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5048  hypothetical protein  37.35 
 
 
570 aa  52.8  1e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.237947  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3317  hypothetical protein  38.6 
 
 
106 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4064  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.830631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>