More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0036 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  100 
 
 
148 aa  300  3e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  72.97 
 
 
148 aa  224  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  68.53 
 
 
147 aa  212  1e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  68.53 
 
 
147 aa  212  1e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  70.71 
 
 
148 aa  208  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  55.48 
 
 
150 aa  169  8e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  59.12 
 
 
139 aa  168  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  57.04 
 
 
145 aa  164  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  56.93 
 
 
148 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  57.46 
 
 
181 aa  157  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  56.3 
 
 
150 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  54.23 
 
 
150 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  54.23 
 
 
150 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  54.23 
 
 
150 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  54.23 
 
 
150 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  54.23 
 
 
150 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  54.23 
 
 
150 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  54.23 
 
 
150 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  53.96 
 
 
148 aa  155  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  54.29 
 
 
146 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  56.3 
 
 
139 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  54.07 
 
 
165 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  54.07 
 
 
150 aa  154  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  56.03 
 
 
148 aa  151  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  50 
 
 
148 aa  151  3e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  50.35 
 
 
154 aa  150  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  54.07 
 
 
145 aa  150  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  48.59 
 
 
146 aa  149  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  49.64 
 
 
143 aa  148  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  51.85 
 
 
149 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  48.67 
 
 
154 aa  146  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  47.14 
 
 
147 aa  145  2e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.15 
 
 
146 aa  144  4e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  50.72 
 
 
145 aa  144  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  49.28 
 
 
144 aa  144  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  51.82 
 
 
145 aa  144  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  50.77 
 
 
146 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  45.39 
 
 
148 aa  138  2e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  45.93 
 
 
153 aa  138  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  47.41 
 
 
146 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
145 aa  133  7e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  48.53 
 
 
144 aa  132  1e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  45.32 
 
 
147 aa  132  2e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  45.32 
 
 
147 aa  132  2e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  45.32 
 
 
147 aa  132  2e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  46.38 
 
 
148 aa  129  1e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  46.67 
 
 
146 aa  129  1e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  42.36 
 
 
149 aa  129  2e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  48.59 
 
 
151 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  44.12 
 
 
144 aa  127  4e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  45.93 
 
 
146 aa  127  5e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  46.04 
 
 
150 aa  126  9e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  50.75 
 
 
162 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  43.75 
 
 
150 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  46.21 
 
 
153 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  45.21 
 
 
151 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
144 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  50 
 
 
162 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  40 
 
 
151 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  41.96 
 
 
152 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  44.7 
 
 
153 aa  118  2e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  43.94 
 
 
153 aa  118  2e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  47.41 
 
 
149 aa  115  1e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  39.86 
 
 
146 aa  114  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  40.43 
 
 
148 aa  114  4e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
164 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  44.7 
 
 
156 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  40.29 
 
 
146 aa  113  7e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  42.14 
 
 
149 aa  113  8e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  46.53 
 
 
173 aa  112  1e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  42.14 
 
 
155 aa  112  1e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
155 aa  112  2e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  40 
 
 
151 aa  111  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  41.96 
 
 
152 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  40.85 
 
 
148 aa  111  4e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  42.14 
 
 
145 aa  111  4e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  45.11 
 
 
167 aa  110  4e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  42.45 
 
 
160 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  40.27 
 
 
151 aa  108  2e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  42.36 
 
 
149 aa  108  2e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  39.72 
 
 
156 aa  107  4e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  42.42 
 
 
153 aa  108  4e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  42.42 
 
 
153 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  39.57 
 
 
153 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  42.42 
 
 
153 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  42.42 
 
 
153 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
151 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  7.6493e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  38.78 
 
 
152 aa  104  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
153 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  40.77 
 
 
131 aa  103  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  40.6 
 
 
160 aa  103  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  42.54 
 
 
149 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
153 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  40 
 
 
145 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  39.69 
 
 
143 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  37.88 
 
 
146 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  42.14 
 
 
150 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  40 
 
 
155 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  35.17 
 
 
154 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
146 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>