20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0034 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  327  5e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  44.3 
 
 
165 aa  137  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  43.9 
 
 
157 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  43.55 
 
 
157 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  36.55 
 
 
157 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  43.55 
 
 
157 aa  107  7e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  37.24 
 
 
157 aa  107  9e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  40.48 
 
 
159 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  37.4 
 
 
157 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  33.12 
 
 
156 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  34.92 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  35.71 
 
 
154 aa  90.5  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  35.29 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  29.94 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  5.34724e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  35.04 
 
 
158 aa  82.4  2e-15  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  32.17 
 
 
180 aa  82.4  2e-15  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  30.77 
 
 
169 aa  72.4  2e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  29.85 
 
 
159 aa  71.2  6e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12991  hypothetical protein  32.71 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>