More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0025 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  62.5 
 
 
231 aa  274  1e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3439  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  63.04 
 
 
229 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  4.13272e-05 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.78 
 
 
231 aa  262  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
237 aa  165  6e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  8.16972e-06 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
237 aa  149  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.19 
 
 
236 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
228 aa  142  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
234 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
234 aa  136  3e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  36.71 
 
 
233 aa  136  3e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
234 aa  135  7e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 
233 aa  133  2e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
244 aa  128  7e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 
233 aa  127  1e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  1.05469e-08 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
240 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
237 aa  125  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  37.18 
 
 
237 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
232 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
235 aa  120  1e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
235 aa  121  1e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
235 aa  120  2e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0943  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.2 
 
 
270 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
237 aa  116  4e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
237 aa  116  4e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
237 aa  116  4e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
236 aa  115  8e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
246 aa  114  1e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.47 
 
 
231 aa  114  1e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0118  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.76 
 
 
256 aa  113  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.1 
 
 
288 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
231 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1682  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.53 
 
 
260 aa  112  7e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 
237 aa  111  7e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
235 aa  110  1e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
227 aa  110  2e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1671  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
260 aa  110  2e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.321944  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0392  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.46 
 
 
258 aa  110  2e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  31.69 
 
 
248 aa  110  2e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  7.34439e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.48 
 
 
226 aa  110  2e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
241 aa  110  2e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0396  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.46 
 
 
258 aa  109  4e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4759  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.47 
 
 
263 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3300  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.45 
 
 
265 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
252 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  27.05 
 
 
256 aa  108  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  7.99282e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0845  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.29 
 
 
243 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4874  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 
263 aa  108  9e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4358  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 
263 aa  108  9e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4522  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 
263 aa  108  9e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0669  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.1 
 
 
259 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0399726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.46 
 
 
252 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00296009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.47 
 
 
263 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
236 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.76 
 
 
226 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 
237 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
246 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4742  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 
252 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
236 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2718  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.55 
 
 
256 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.158048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
263 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1421  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.6 
 
 
251 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.91 
 
 
259 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2699  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.47 
 
 
253 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.63 
 
 
258 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4732  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.47 
 
 
252 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.72 
 
 
258 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4454  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.46 
 
 
263 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.12 
 
 
257 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.91 
 
 
256 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
251 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1686  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.58 
 
 
244 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  2.34633e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2468  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  28.63 
 
 
256 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.11328e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 
237 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2793  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.59 
 
 
256 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313223  normal  0.208363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1587  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.71 
 
 
244 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  6.00536e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1608  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.58 
 
 
244 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.63068e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.42 
 
 
244 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.90955e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1906  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
244 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.58661e-10  hitchhiker  7.2353e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1578  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.58 
 
 
244 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.95818e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.04 
 
 
248 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
246 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
249 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.59 
 
 
256 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2808  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
244 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.27771e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0575  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.13 
 
 
258 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
236 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 
245 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3499  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.17 
 
 
244 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  2.00481e-09  hitchhiker  0.00699143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  30.65 
 
 
257 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0374  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.27 
 
 
244 aa  103  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.333975  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
270 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3073  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.2 
 
 
256 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.789258 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
225 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.74 
 
 
277 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1057  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.13 
 
 
259 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
247 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1623  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 
244 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.63996e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.4 
 
 
250 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
248 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>