More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0012 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
284 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  78.87 
 
 
284 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  78.87 
 
 
284 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  76.68 
 
 
284 aa  461  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  77.39 
 
 
284 aa  458  1e-128  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  75.7 
 
 
284 aa  460  1e-128  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  58.36 
 
 
289 aa  349  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 
292 aa  345  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  1.07141e-10  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  54.29 
 
 
309 aa  336  3e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 
287 aa  335  6e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  56.34 
 
 
284 aa  335  6e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 
284 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 
296 aa  334  9e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 
284 aa  333  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  57.5 
 
 
284 aa  331  7e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 
296 aa  327  1e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 
293 aa  323  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  56.94 
 
 
285 aa  322  3e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  57.4 
 
 
283 aa  319  4e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  56.2 
 
 
284 aa  318  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  51.94 
 
 
288 aa  318  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
284 aa  318  9e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  54.15 
 
 
288 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 
300 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.3119e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  54.55 
 
 
286 aa  315  5e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  56.43 
 
 
300 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 
295 aa  313  2e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 
296 aa  313  2e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  55.47 
 
 
284 aa  312  4e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  54.74 
 
 
290 aa  309  3e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  54.04 
 
 
284 aa  307  1e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 
284 aa  306  4e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  52.46 
 
 
287 aa  305  5e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 
286 aa  305  8e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 
286 aa  305  8e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 
299 aa  303  2e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 
285 aa  299  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  51.75 
 
 
286 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
287 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 
289 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  51.94 
 
 
307 aa  283  3e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
285 aa  281  6e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
287 aa  281  8e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  49.64 
 
 
297 aa  281  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
284 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
294 aa  278  6e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  48.77 
 
 
287 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 
290 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 
288 aa  275  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 
299 aa  275  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 
284 aa  274  1e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.81715e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
289 aa  274  1e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  48.01 
 
 
280 aa  273  2e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 
284 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  47.46 
 
 
295 aa  272  5e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 
283 aa  270  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 
287 aa  270  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
297 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 
283 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 
284 aa  267  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 
284 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 
283 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
284 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  47.65 
 
 
282 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  47.65 
 
 
282 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
295 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  47.37 
 
 
287 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  47.72 
 
 
287 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  46.62 
 
 
284 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 
284 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  47.29 
 
 
282 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 
295 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 
283 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  45.36 
 
 
282 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  45.3 
 
 
304 aa  262  5e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 
287 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  46.57 
 
 
282 aa  261  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 
310 aa  261  9e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 
283 aa  261  9e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  2.62425e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 
283 aa  261  9e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 
291 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  46.64 
 
 
291 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  48.74 
 
 
282 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  45.64 
 
 
287 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 
297 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 
289 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  46.93 
 
 
283 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  46.21 
 
 
302 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 
287 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 
289 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 
287 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  46.57 
 
 
282 aa  258  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 
283 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  8.05788e-08  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 
283 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 
283 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  7.94151e-09  decreased coverage  5.44491e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 
283 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  2.9138e-06  hitchhiker  5.93821e-13 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 
283 aa  257  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  43.46 
 
 
282 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  7.82528e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 
287 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.57 
 
 
285 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>