119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0002 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  100 
 
 
299 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  61.87 
 
 
318 aa  362  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  61.54 
 
 
318 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  56.76 
 
 
318 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  53.69 
 
 
314 aa  335  6e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  54.7 
 
 
313 aa  334  9e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  53.4 
 
 
349 aa  332  5e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  41.52 
 
 
300 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  7.35368e-06  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47601  predicted protein  35.9 
 
 
404 aa  182  8e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32069  predicted protein  35.86 
 
 
319 aa  163  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2738  predicted protein  35.65 
 
 
235 aa  147  1e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119481  homogentisate phytylprenyltransferase/homogentisic acid geranylgeranyl transferase  31.85 
 
 
387 aa  133  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.19 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.52 
 
 
306 aa  82.4  9e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.98 
 
 
297 aa  82  1e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.72 
 
 
303 aa  78.2  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  26.11 
 
 
338 aa  77.4  3e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.14 
 
 
302 aa  75.9  7e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.07 
 
 
302 aa  75.1  1e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.07 
 
 
302 aa  75.5  1e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  28.57 
 
 
305 aa  73.2  5e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  30.29 
 
 
333 aa  72.8  7e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  29.41 
 
 
334 aa  72.4  8e-12  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.54 
 
 
315 aa  71.6  1e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.74 
 
 
301 aa  71.2  2e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.67 
 
 
274 aa  70.5  3e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  25.54 
 
 
336 aa  70.5  4e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  28.57 
 
 
335 aa  70.1  4e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  27.66 
 
 
334 aa  69.3  7e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.67 
 
 
295 aa  68.9  9e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  25.41 
 
 
337 aa  68.2  1e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.05 
 
 
309 aa  68.6  1e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.67 
 
 
295 aa  67.8  2e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  29.45 
 
 
277 aa  65.5  1e-09  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.43 
 
 
303 aa  64.3  2e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  24.86 
 
 
335 aa  64.3  2e-09  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.83 
 
 
300 aa  64.7  2e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.04 
 
 
305 aa  65.1  2e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.63 
 
 
303 aa  64.7  2e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  25.91 
 
 
333 aa  63.5  4e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  25.23 
 
 
283 aa  63.5  4e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  30.59 
 
 
282 aa  63.2  6e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  2.76603e-06 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  33.53 
 
 
281 aa  62.8  7e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  25.27 
 
 
333 aa  62.4  9e-09  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.41 
 
 
304 aa  62  1e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  27.37 
 
 
279 aa  61.2  2e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.67 
 
 
299 aa  60.8  2e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.39 
 
 
330 aa  61.2  2e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.67 
 
 
300 aa  60.5  3e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  22.32 
 
 
293 aa  60.8  3e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  28.05 
 
 
317 aa  60.5  3e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.49 
 
 
317 aa  59.7  5e-08  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.63 
 
 
315 aa  59.7  6e-08  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.63 
 
 
315 aa  59.7  6e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.72 
 
 
315 aa  59.3  7e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.11 
 
 
315 aa  58.9  9e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  23.77 
 
 
290 aa  58.9  9e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.09 
 
 
330 aa  58.5  1e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  28.07 
 
 
267 aa  57.8  2e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1852  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.73 
 
 
294 aa  58.2  2e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.93 
 
 
332 aa  57.8  2e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.39 
 
 
330 aa  58.2  2e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.65 
 
 
325 aa  57  3e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.49 
 
 
276 aa  57.4  3e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3266  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.47 
 
 
304 aa  57.4  3e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.21 
 
 
334 aa  57.4  3e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  24.29 
 
 
299 aa  57  4e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.34 
 
 
284 aa  56.6  4e-07  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.34 
 
 
316 aa  56.6  4e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.77 
 
 
333 aa  56.2  6e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.42 
 
 
316 aa  56.2  6e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.23 
 
 
376 aa  56.2  6e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.42 
 
 
316 aa  56.2  6e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.99 
 
 
318 aa  55.8  8e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.45 
 
 
326 aa  54.3  3e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2632  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.49 
 
 
310 aa  53.9  3e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.17 
 
 
333 aa  53.5  4e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  25.29 
 
 
288 aa  53.5  4e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.51 
 
 
337 aa  53.5  4e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  23.66 
 
 
340 aa  53.5  4e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  26.6 
 
 
343 aa  53.5  4e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30 
 
 
320 aa  53.1  5e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.83 
 
 
279 aa  53.1  5e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.22 
 
 
339 aa  53.1  5e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  28.96 
 
 
185 aa  52.8  8e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1892  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.83 
 
 
326 aa  52.4  9e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0278945  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2065  UbiA prenyltransferase  30.56 
 
 
245 aa  52.4  1e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  24.26 
 
 
296 aa  52.4  1e-05  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1866  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.83 
 
 
326 aa  52.4  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.74 
 
 
333 aa  51.2  2e-05  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.11 
 
 
317 aa  50.4  3e-05  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  23.42 
 
 
302 aa  50.4  4e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  30.12 
 
 
281 aa  50.4  4e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.89 
 
 
336 aa  49.7  5e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  24.39 
 
 
301 aa  50.1  5e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  26.43 
 
 
282 aa  50.1  5e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  25.45 
 
 
283 aa  49.3  7e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  26.62 
 
 
284 aa  49.3  7e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  25.32 
 
 
285 aa  49.3  8e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  24.67 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>