More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4274 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4274  6-phosphogluconate phosphatase  100 
 
 		 221 aa  461  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4594  6-phosphogluconate phosphatase  98.64 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.348928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  72.27 
 
 		 223 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  70.45 
 
 		 222 aa  342  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0020  6-phosphogluconate phosphatase  65.91 
 
 		 221 aa  301  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4162  6-phosphogluconate phosphatase  66.82 
 
 		 222 aa  297  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4188  6-phosphogluconate phosphatase  65.45 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274934  hitchhiker  0.00681346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4240  6-phosphogluconate phosphatase  65.45 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  58.64 
 
 		 221 aa  288  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.107109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  58.18 
 
 		 221 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580327 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4252  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.18 
 
 		 221 aa  286  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  57.73 
 
 		 221 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  58.64 
 
 		 221 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  58.64 
 
 		 221 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  58.64 
 
 		 221 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  58.64 
 
 		 221 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03599  predicted hydrolase  57.73 
 
 		 221 aa  285  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4279  6-phosphogluconate phosphatase  57.73 
 
 		 221 aa  285  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4224  6-phosphogluconate phosphatase  57.73 
 
 		 221 aa  285  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03543  hypothetical protein  57.73 
 
 		 221 aa  285  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3929  6-phosphogluconate phosphatase  57.73 
 
 		 221 aa  285  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  59.09 
 
 		 221 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  38.07 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.15 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000204  putative phosphatase YieH  40.44 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0113  HAD family hydrolase  40.44 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254082  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  34.31 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.64 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 212 aa  131  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0436  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  34.78 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4494  HAD family hydrolase  39.25 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  32.56 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.19 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  31.58 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  31.13 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  32.27 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  31.19 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  33.69 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  31.02 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  30.28 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  32.04 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  31.13 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  31.08 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  30.99 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  30.14 
 
 		 260 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  30.66 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.16 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  30.58 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  28.17 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  28.11 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.05 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.39 
 
 		 232 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.39 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.69 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  24.73 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  29.38 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  30.98 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  30.98 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 231 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.65 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  27 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  26.74 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  30.39 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.39 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 245 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.05 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  29.51 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  26.83 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  29.51 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  29.51 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  29.51 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  29.51 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  29.51 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 255 aa  91.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.03 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  28.34 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  29.28 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  27.81 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  27.65 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  25.5 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  25.5 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.61 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>