More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4177 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  100 
 
 		 561 aa  1123    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  71.01 
 
 		 557 aa  753    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  62.78 
 
 		 547 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.02 
 
 		 546 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  80.26 
 
 		 546 aa  845    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  80.99 
 
 		 558 aa  877    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  95.04 
 
 		 565 aa  1066    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  65.62 
 
 		 563 aa  690    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  57.75 
 
 		 583 aa  590  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  54.51 
 
 		 575 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  56.02 
 
 		 536 aa  551  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  52.57 
 
 		 661 aa  524  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  52.11 
 
 		 551 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  50.65 
 
 		 541 aa  508  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  49.12 
 
 		 619 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  48.9 
 
 		 573 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  49.19 
 
 		 571 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 594 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  48.14 
 
 		 573 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  48.29 
 
 		 588 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  48.66 
 
 		 597 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  50.18 
 
 		 565 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  47.85 
 
 		 597 aa  485  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.75 
 
 		 548 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  49.54 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.71 
 
 		 643 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 		 539 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  50.94 
 
 		 547 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.03 
 
 		 584 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.6 
 
 		 572 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.15 
 
 		 578 aa  465  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  44.52 
 
 		 592 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  49.72 
 
 		 542 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  48.15 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  41.43 
 
 		 606 aa  458  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  44.65 
 
 		 592 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  43.21 
 
 		 612 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.59 
 
 		 564 aa  455  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  44.47 
 
 		 592 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  47.35 
 
 		 547 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  43.86 
 
 		 609 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.76 
 
 		 617 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  42.47 
 
 		 609 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.67 
 
 		 619 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  45.66 
 
 		 606 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  45.29 
 
 		 600 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.78 
 
 		 611 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  42.22 
 
 		 588 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  43.36 
 
 		 549 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 		 540 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  44.03 
 
 		 545 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  42.99 
 
 		 562 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  40.49 
 
 		 522 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  47.63 
 
 		 538 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.31 
 
 		 531 aa  438  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  42.31 
 
 		 615 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  44.09 
 
 		 549 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  45.3 
 
 		 541 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  45.88 
 
 		 534 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  44.22 
 
 		 568 aa  433  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  46.14 
 
 		 550 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  41.57 
 
 		 627 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  44.28 
 
 		 534 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  43.4 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  44.28 
 
 		 552 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.44 
 
 		 590 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  47.69 
 
 		 556 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  41.76 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  42.11 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  44.28 
 
 		 552 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  47.28 
 
 		 528 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  42.05 
 
 		 593 aa  428  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  45.45 
 
 		 543 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.07 
 
 		 548 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  41.77 
 
 		 633 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 571 aa  428  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  46.3 
 
 		 532 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  43.45 
 
 		 550 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  44.82 
 
 		 557 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  43.46 
 
 		 613 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  40.51 
 
 		 611 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.57 
 
 		 586 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  44.36 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  44.02 
 
 		 539 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  45.45 
 
 		 543 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  40.13 
 
 		 627 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  45.2 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  41.36 
 
 		 547 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  44.28 
 
 		 553 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.59 
 
 		 629 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  39.32 
 
 		 629 aa  422  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.34 
 
 		 544 aa  425  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.76 
 
 		 632 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  43.88 
 
 		 539 aa  425  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 		 619 aa  425  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 		 602 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.45 
 
 		 534 aa  425  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  42.07 
 
 		 564 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.25 
 
 		 596 aa  425  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>