228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4169 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  95.51 
 
 		 268 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  90.3 
 
 		 268 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  88.06 
 
 		 268 aa  417  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  65.4 
 
 		 268 aa  318  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  67.8 
 
 		 270 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  57.36 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  58.27 
 
 		 267 aa  275  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  55.09 
 
 		 268 aa  270  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  57.69 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  51.94 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  57.36 
 
 		 263 aa  262  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  58.17 
 
 		 269 aa  261  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  56.06 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  55.25 
 
 		 265 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  55.09 
 
 		 265 aa  248  8e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  48.66 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  52.61 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  59.07 
 
 		 263 aa  244  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  57.42 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  53.23 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  51.93 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  58.14 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  50.39 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  52.36 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  52.55 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  53.82 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  48.82 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  48.43 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  48.43 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  46.67 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  48.5 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  46.29 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  47.37 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  47.24 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  47.21 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  48.77 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  47.24 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  47.84 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  47.68 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  45.06 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  47.66 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  47.24 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0611  hypothetical protein  44.75 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  49.22 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  40.46 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  40.46 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  51.03 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  48.72 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  44.11 
 
 		 268 aa  198  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  50.95 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  48.07 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  42.8 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  41.45 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2670  hypothetical protein  45.49 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  43.19 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  40.17 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  43.08 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  46.34 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  42.75 
 
 		 273 aa  178  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  41.63 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  41.29 
 
 		 298 aa  175  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  44.49 
 
 		 269 aa  174  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  42.06 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  41.76 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  43.75 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  44.83 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  40.62 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  41.27 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  42.56 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  40.71 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  48.5 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  42.15 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  38.11 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  41.6 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  39.92 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  41.32 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  37.55 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  41.32 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  41.74 
 
 		 266 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  40.93 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1144  hypothetical protein  42.98 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  40.91 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  39.92 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  37.21 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  40.91 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  37.02 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1621  permease  40.78 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1134  hypothetical protein  41.5 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1333  hypothetical protein  42.17 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  38.74 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  39.09 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  39.69 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  39.48 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  35.59 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  37.4 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  32.05 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  37.01 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  34.05 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>