More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4093 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 257 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  74.9 
 
 		 258 aa  410  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  70.52 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  70.52 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  70.52 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  71.83 
 
 		 263 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  70.12 
 
 		 257 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  68.65 
 
 		 263 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  63.71 
 
 		 258 aa  335  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  49.4 
 
 		 249 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  49.8 
 
 		 256 aa  242  6e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  47.6 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  45.78 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  44.94 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  44.49 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43.82 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  43.6 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  43.6 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  44.27 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  45.9 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  43.36 
 
 		 521 aa  206  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  42.8 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  43.43 
 
 		 535 aa  204  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  42.04 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  41.7 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  41.56 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  42.39 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  38 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  42.28 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  41.39 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  41.39 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.56 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.56 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.56 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.15 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.15 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.15 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.15 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  41.49 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 		 250 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.15 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  42.5 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  41.7 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  38.31 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.09 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  38.1 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  39.04 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.95 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  33.33 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  36.03 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  38.66 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  37.82 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  32.92 
 
 		 231 aa  142  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 		 272 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  37.14 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 		 257 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  32.5 
 
 		 231 aa  138  7e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.73 
 
 		 515 aa  138  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  32.54 
 
 		 516 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.2 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  31.2 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  33.07 
 
 		 249 aa  135  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.75 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  31.1 
 
 		 515 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 		 252 aa  131  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  29.53 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>