196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3986 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  94.33 
 
 		 441 aa  836    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 441 aa  906    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  42.27 
 
 		 500 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  35.52 
 
 		 451 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  35.76 
 
 		 453 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  34.83 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  33.95 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  32.05 
 
 		 456 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  31.82 
 
 		 455 aa  187  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  31.47 
 
 		 456 aa  183  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  28.37 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  31.44 
 
 		 451 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 		 483 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  31.37 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  30.02 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  29.18 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  27.25 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  33.17 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  27.29 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  29.53 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  31.04 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.18 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  31.05 
 
 		 456 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  30.89 
 
 		 453 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  28.82 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  33.54 
 
 		 482 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  30.41 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  29.02 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  28.87 
 
 		 458 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  26.04 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  28.32 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  31.64 
 
 		 454 aa  147  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  27.06 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  28.54 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  27.48 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  25.91 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  29.91 
 
 		 454 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  23.96 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  28 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  27.92 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  24.33 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  27.54 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  29.93 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  29.3 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  28.96 
 
 		 443 aa  133  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  23.95 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  31.85 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  28.9 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  30.51 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  29.29 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  27.97 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  28.5 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  27.64 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  28.29 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  29.48 
 
 		 503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.45 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  27.84 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  29.72 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  29.72 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  32.14 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  35.22 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  29.98 
 
 		 472 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  27.06 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.24 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.6 
 
 		 486 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  28.54 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  27.91 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  30.62 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  27.05 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  35.94 
 
 		 444 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  27.04 
 
 		 461 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  27.15 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  32.27 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.59 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0288  putative MmgE/PrpD family protein  30.47 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  32.15 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  27.9 
 
 		 464 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  27.75 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  27.9 
 
 		 464 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  26.24 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  24.83 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  23.57 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  28.82 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  25.72 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  22.96 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  24.93 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  28.17 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  25.35 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  26.09 
 
 		 474 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 453 aa  100  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  28.17 
 
 		 468 aa  99.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  24.18 
 
 		 501 aa  99.8  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  24.94 
 
 		 485 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2428  MmgE/PrpD  33.1 
 
 		 404 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0639632  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7945  MmgE/PrpD family protein  29.64 
 
 		 465 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762062  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  25.64 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  26.2 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>