More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3877 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.22 
 
 		 334 aa  634    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.22 
 
 		 334 aa  634    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.52 
 
 		 334 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  90.96 
 
 		 334 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.22 
 
 		 334 aa  636    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.52 
 
 		 334 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  89.22 
 
 		 334 aa  634    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.52 
 
 		 334 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.22 
 
 		 334 aa  634    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.52 
 
 		 334 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.52 
 
 		 334 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.52 
 
 		 334 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  90.42 
 
 		 334 aa  641    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.52 
 
 		 334 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 334 aa  696    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  91.62 
 
 		 334 aa  651    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.22 
 
 		 334 aa  634    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.9 
 
 		 334 aa  684    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  88.62 
 
 		 334 aa  630  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  88.62 
 
 		 334 aa  630  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  87.39 
 
 		 346 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  87.39 
 
 		 346 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  87.09 
 
 		 346 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  80.12 
 
 		 333 aa  577  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 332 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.11 
 
 		 332 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.11 
 
 		 332 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 332 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 332 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.51 
 
 		 332 aa  532  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.21 
 
 		 332 aa  527  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  71 
 
 		 332 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.02 
 
 		 332 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4193  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.11 
 
 		 332 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.81 
 
 		 332 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.81 
 
 		 332 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.81 
 
 		 332 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.12 
 
 		 335 aa  510  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.43 
 
 		 335 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0246  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.69 
 
 		 336 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.64 
 
 		 338 aa  493  9.999999999999999e-139  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.46 
 
 		 365 aa  484  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.87 
 
 		 335 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.77 
 
 		 335 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.97 
 
 		 337 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.93 
 
 		 345 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 		 338 aa  464  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.56 
 
 		 333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 334 aa  428  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.31 
 
 		 336 aa  424  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 328 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 332 aa  359  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 351 aa  358  8e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 329 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 352 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 337 aa  354  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 346 aa  352  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  351  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  352  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 344 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 344 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0815  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0575  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 329 aa  350  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.415055  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 		 344 aa  348  6e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 328 aa  347  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 331 aa  346  3e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1014  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00140566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0995  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 336 aa  339  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 336 aa  339  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25860  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.986155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 348 aa  335  5e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 347 aa  335  9e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0984  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 355 aa  328  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0949  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 341 aa  325  5e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>