More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3855 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3855  para-aminobenzoate synthase component II  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  97.91 
 
 		 238 aa  393  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4583  para-aminobenzoate synthase component II  83.16 
 
 		 191 aa  338  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3948  para-aminobenzoate synthase component II  83.16 
 
 		 191 aa  336  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3705  para-aminobenzoate synthase component II  83.16 
 
 		 191 aa  336  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0244  para-aminobenzoate synthase component II  83.16 
 
 		 191 aa  336  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0673282  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0367  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  82.11 
 
 		 192 aa  333  7.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  80.1 
 
 		 191 aa  329  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  74.07 
 
 		 187 aa  298  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  71.73 
 
 		 201 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  74.6 
 
 		 187 aa  297  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  73.3 
 
 		 187 aa  296  9e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  74.6 
 
 		 187 aa  296  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.234421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  74.07 
 
 		 187 aa  295  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  74.07 
 
 		 187 aa  295  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  74.07 
 
 		 187 aa  295  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5115  anthranilate synthase component II  71.73 
 
 		 197 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  74.07 
 
 		 187 aa  295  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  74.07 
 
 		 187 aa  295  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  71.58 
 
 		 187 aa  294  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  73.54 
 
 		 187 aa  294  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2729  para-aminobenzoate synthase component II  69.11 
 
 		 192 aa  294  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  71.58 
 
 		 187 aa  293  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  71.58 
 
 		 187 aa  293  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0549  Para-aminobenzoate synthase, glutamine amidotransferase component  72.25 
 
 		 196 aa  293  1e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.481962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  71.58 
 
 		 187 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  71.05 
 
 		 187 aa  292  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0450  anthranilate synthase component II  70.68 
 
 		 197 aa  291  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  70.53 
 
 		 192 aa  290  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  70.16 
 
 		 201 aa  291  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0453  anthranilate synthase component II  70.16 
 
 		 197 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3946  anthranilate synthase component II  69.63 
 
 		 198 aa  290  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0420  anthranilate synthase component II  69.63 
 
 		 197 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0538249  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4783  anthranilate synthase component II  69.63 
 
 		 197 aa  288  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0592  anthranilate synthase, component II  69.63 
 
 		 199 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747776  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2196  para-aminobenzoate synthase component II  71.73 
 
 		 193 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  67.54 
 
 		 192 aa  287  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46130  anthranilate synthase component II  70.68 
 
 		 197 aa  286  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  68.06 
 
 		 197 aa  285  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  69.11 
 
 		 199 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00080  para-aminobenzoate synthase component II  69.47 
 
 		 195 aa  281  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  68.06 
 
 		 192 aa  281  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0752  anthranilate synthase, component II  65.97 
 
 		 192 aa  280  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  65.97 
 
 		 197 aa  280  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  70.37 
 
 		 195 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2495  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  67.54 
 
 		 193 aa  275  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0786321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2801  anthranilate synthase component II  63.87 
 
 		 202 aa  271  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0606  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  67.37 
 
 		 191 aa  270  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  65.45 
 
 		 197 aa  270  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  65.45 
 
 		 187 aa  270  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0607  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  67.37 
 
 		 203 aa  269  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00205694  normal  0.186857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  65.97 
 
 		 189 aa  268  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3024  anthranilate synthase component II  65.26 
 
 		 205 aa  267  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00296432  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3423  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  66.84 
 
 		 196 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585956  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0613  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  66.84 
 
 		 191 aa  266  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.53 
 
 		 192 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  66.49 
 
 		 191 aa  265  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  66.49 
 
 		 204 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  64.21 
 
 		 188 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0567  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  66.67 
 
 		 194 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000013405  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3124  anthranilate synthase component II  64.21 
 
 		 189 aa  264  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2321  anthranilate synthase, component II  66.84 
 
 		 195 aa  264  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0251502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3701  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  67.2 
 
 		 194 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000872657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3758  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  67.2 
 
 		 194 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000630445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3884  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  67.2 
 
 		 194 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.012296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  67.02 
 
 		 190 aa  263  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  63.16 
 
 		 189 aa  263  8.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2882  anthranilate synthase component II  64.74 
 
 		 189 aa  263  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2759  anthranilate synthase component II  63.68 
 
 		 189 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0368  anthranilate synthase component II  65.96 
 
 		 190 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  66.32 
 
 		 190 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  66.32 
 
 		 190 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0358  anthranilate synthase component II  65.96 
 
 		 190 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1581  anthranilate synthase component II  64.4 
 
 		 191 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0806  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  63.68 
 
 		 197 aa  262  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000445998  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3615  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  64.02 
 
 		 194 aa  261  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  63.16 
 
 		 190 aa  260  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0974  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 		 207 aa  259  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000708757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  62.63 
 
 		 190 aa  260  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  60.53 
 
 		 192 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  66.32 
 
 		 193 aa  259  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3015  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  65.97 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2585  anthranilate synthase component II  60.85 
 
 		 195 aa  258  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3179  anthranilate synthase component II  63.16 
 
 		 189 aa  258  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0526  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.11 
 
 		 202 aa  258  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  61.05 
 
 		 189 aa  257  6e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0638  anthranilate synthase component II  61.78 
 
 		 199 aa  257  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0641  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  65.45 
 
 		 192 aa  257  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1441  anthranilate synthase component II  61.78 
 
 		 207 aa  257  9e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.100747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0575  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  65.26 
 
 		 195 aa  256  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0267305  normal  0.552155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3605  anthranilate synthase component II  64.77 
 
 		 208 aa  255  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.240756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.96 
 
 		 188 aa  256  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4455  anthranilate synthase component II  62.96 
 
 		 190 aa  255  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2910  anthranilate synthase component II  63.68 
 
 		 196 aa  254  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.42 
 
 		 195 aa  254  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4160  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  63.87 
 
 		 190 aa  254  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3576  anthranilate synthase component II  63.16 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1454  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.9 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0645  anthranilate synthase component II  63.16 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3652  anthranilate synthase component II  63.73 
 
 		 194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>