More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3773 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  46.61 
 
 
828 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  50.76 
 
 
794 aa  698    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
701 aa  1452    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  75.07 
 
 
696 aa  1105    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  46.76 
 
 
828 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  48.21 
 
 
797 aa  675    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  74.22 
 
 
696 aa  1090    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  74.36 
 
 
696 aa  1092    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  55.82 
 
 
736 aa  834    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  46.91 
 
 
828 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  74.22 
 
 
696 aa  1089    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  51.07 
 
 
820 aa  697    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  74.36 
 
 
698 aa  1093    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  76.1 
 
 
705 aa  1118    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  74.22 
 
 
696 aa  1088    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  41.83 
 
 
705 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  39.39 
 
 
729 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  37.95 
 
 
752 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  37.13 
 
 
747 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  38.65 
 
 
729 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  37.13 
 
 
747 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  36.99 
 
 
747 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  38.51 
 
 
729 aa  487  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  37.55 
 
 
729 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  36.45 
 
 
747 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  36.18 
 
 
747 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  37.34 
 
 
729 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  37.95 
 
 
703 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  37.95 
 
 
703 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  36.31 
 
 
747 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  36.36 
 
 
745 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  38.12 
 
 
717 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  37.99 
 
 
740 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  40.18 
 
 
797 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 
747 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  36.31 
 
 
747 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  40.21 
 
 
806 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.9 
 
 
833 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  36.78 
 
 
714 aa  441  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  37.91 
 
 
808 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  36.74 
 
 
735 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  36.88 
 
 
810 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  37.12 
 
 
789 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  35.27 
 
 
713 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  35.08 
 
 
723 aa  425  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  37.72 
 
 
810 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 
810 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  37.15 
 
 
817 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  37.32 
 
 
748 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  34.94 
 
 
802 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  36.93 
 
 
806 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 
738 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  36.93 
 
 
810 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  36.01 
 
 
753 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  36.01 
 
 
737 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  36.01 
 
 
753 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 
741 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 
752 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 
736 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 
753 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  36.65 
 
 
829 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 
736 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  34.51 
 
 
733 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  36.19 
 
 
808 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  35.65 
 
 
716 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 
821 aa  399  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  36.32 
 
 
791 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 
745 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  36.9 
 
 
778 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  36.78 
 
 
819 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 
757 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 
750 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 
734 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  36.32 
 
 
791 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  35.62 
 
 
801 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  36.16 
 
 
784 aa  392  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 
785 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 
785 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 
715 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 
829 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  34.98 
 
 
771 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 
701 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  34.11 
 
 
715 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  34.72 
 
 
711 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 
733 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 
828 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 
729 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 
750 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 
771 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 
729 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 
750 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.67 
 
 
689 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  34.27 
 
 
718 aa  379  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 
753 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 
745 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 
699 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 
754 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  36.67 
 
 
724 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 
754 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  35.82 
 
 
733 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>