More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3684 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3684  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 297 aa  607  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3878  chromosome replication initiation inhibitor protein  98.32 
 
 		 297 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0559  chromosome replication initiation inhibitor protein  94.95 
 
 		 297 aa  580  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0518  chromosome replication initiation inhibitor protein  94.61 
 
 		 297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3925  chromosome replication initiation inhibitor protein  93.58 
 
 		 297 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0854  chromosome replication initiation inhibitor protein  91.89 
 
 		 302 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00300239  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3821  chromosome replication initiation inhibitor protein  91.89 
 
 		 302 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.353961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0857  chromosome replication initiation inhibitor protein  91.89 
 
 		 302 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02747  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.88 
 
 		 297 aa  554  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0777  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  90.88 
 
 		 297 aa  554  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02710  hypothetical protein  90.88 
 
 		 297 aa  554  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3243  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.88 
 
 		 297 aa  554  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.361223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0794  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.88 
 
 		 297 aa  554  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3336  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.88 
 
 		 297 aa  554  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3052  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.88 
 
 		 297 aa  554  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4212  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.88 
 
 		 297 aa  554  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.307213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3074  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.88 
 
 		 297 aa  554  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.093516  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3237  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.54 
 
 		 297 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3299  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.54 
 
 		 297 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3225  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.54 
 
 		 297 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0441076  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3404  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.54 
 
 		 297 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269089  normal  0.216257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3302  chromosome replication initiation inhibitor protein  90.54 
 
 		 297 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.779303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3334  chromosome replication initiation inhibitor protein  89.86 
 
 		 297 aa  549  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.197754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03558  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.8 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002477  chromosome initiation inhibitor  47.99 
 
 		 298 aa  289  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1009  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.3 
 
 		 295 aa  288  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1473  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.28 
 
 		 297 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.31 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1012  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.28 
 
 		 298 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4135  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.26 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.931472  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.73 
 
 		 299 aa  235  9e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  45.77 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.69 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.89 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.08 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.06 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.18 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.28 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.32 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.38 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.94 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.06 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.11 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.32 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.41 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.03 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.72 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.79 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  40.97 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.46 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.3 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.64 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.55 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.07 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.07 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.07 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.3 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.3 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.3 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.3 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.3 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.96 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.96 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.85 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  39.25 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.27 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.8 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.24 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.81 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4361  chromosome initiation inhibitor  38.14 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.46 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  41.11 
 
 		 284 aa  178  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.54 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.38 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.38 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.54 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.54 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.19 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.13 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.68 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.24 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.91 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0880  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.17 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.29 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2058  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.21 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.29 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.47 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.04 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.37 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.04 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.04 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.04 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.96 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>