124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3660 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  97.38 
 
 		 191 aa  363  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  90.48 
 
 		 190 aa  339  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  90.48 
 
 		 190 aa  337  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  84.95 
 
 		 203 aa  318  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  84.95 
 
 		 203 aa  318  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  84.95 
 
 		 203 aa  318  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  77.54 
 
 		 188 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  77.54 
 
 		 188 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  77.54 
 
 		 188 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  77.54 
 
 		 188 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  77.54 
 
 		 188 aa  288  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  76.88 
 
 		 188 aa  287  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  76.47 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  76.47 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  76.47 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  76.47 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  76.47 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  76.47 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  76.47 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  75.94 
 
 		 188 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  75.94 
 
 		 188 aa  281  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  79.57 
 
 		 199 aa  278  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  67.22 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  64.92 
 
 		 203 aa  248  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  66.13 
 
 		 203 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  65.38 
 
 		 197 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  68.33 
 
 		 183 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  63.49 
 
 		 188 aa  241  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  65.22 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  69.23 
 
 		 190 aa  238  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  65.59 
 
 		 197 aa  238  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  63.35 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  64.52 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  65.05 
 
 		 187 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  64.64 
 
 		 197 aa  235  3e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  62.09 
 
 		 203 aa  234  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  63.16 
 
 		 199 aa  234  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  63.16 
 
 		 189 aa  234  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  63.98 
 
 		 187 aa  233  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  64.61 
 
 		 196 aa  233  9e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  62.63 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  62.63 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  65.05 
 
 		 197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  62.63 
 
 		 189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  63.44 
 
 		 187 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  60.96 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  63.98 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  62.43 
 
 		 197 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  64.32 
 
 		 193 aa  224  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1320  membrane protein  59.32 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  62.98 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  56.28 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  55.98 
 
 		 214 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  55.98 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0695  gpr1/fun34/YaaH family protein  61.83 
 
 		 200 aa  216  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  61.02 
 
 		 196 aa  214  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1006  GPR1/FUN34/yaaH family protein  63.44 
 
 		 187 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0753776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3283  GPR1/FUN34/yaaH family protein  63.44 
 
 		 187 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0944573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  61.88 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  59.78 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  59.14 
 
 		 194 aa  207  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  59.34 
 
 		 186 aa  204  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  58.06 
 
 		 200 aa  201  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  57.75 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  46.15 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.82 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1065  putative regulatory protein  44.81 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  49.2 
 
 		 189 aa  157  9e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1100  GPR1/FUN34/yaaH family protein  50.82 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.679326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.05 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.6 
 
 		 201 aa  140  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  45.56 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  44.2 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  41.62 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.05 
 
 		 202 aa  127  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  44.44 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.54 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.85 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.16 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1253  GPR1/FUN34/yaaH family protein  44.32 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284277  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1352  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.58 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000041614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.15 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.32 
 
 		 255 aa  117  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.54 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.58 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0815  GPR1/FUN34/YaaH family protein  36.96 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  38.54 
 
 		 258 aa  99  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  35.98 
 
 		 257 aa  98.2  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3336  hypothetical protein  37.57 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000909805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3301  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.57 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.83805e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3597  hypothetical protein  37.57 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3560  hypothetical protein  37.57 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3650  hypothetical protein  37.57 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1667  hypothetical protein  37.57 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  hitchhiker  6.45658e-23 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83722  Accumulation of DYads  39.23 
 
 		 274 aa  96.7  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3556  hypothetical protein  37.04 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000310297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3251  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.04 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000382822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3551  hypothetical protein  37.04 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8351e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>