267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3641 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 160 aa  333  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  98.12 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  84.38 
 
 		 165 aa  291  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  88.75 
 
 		 160 aa  289  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  81.25 
 
 		 160 aa  284  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  81.25 
 
 		 160 aa  284  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  81.25 
 
 		 160 aa  284  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  79.25 
 
 		 196 aa  276  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  79.25 
 
 		 196 aa  276  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  79.25 
 
 		 159 aa  276  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  79.25 
 
 		 159 aa  276  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  79.25 
 
 		 159 aa  276  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  79.25 
 
 		 159 aa  276  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  79.25 
 
 		 159 aa  276  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  79.25 
 
 		 159 aa  276  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  79.25 
 
 		 196 aa  275  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  80.62 
 
 		 160 aa  275  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  77.99 
 
 		 159 aa  273  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  77.99 
 
 		 159 aa  273  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  77.99 
 
 		 159 aa  273  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  77.99 
 
 		 159 aa  273  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  77.99 
 
 		 159 aa  273  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  76.73 
 
 		 159 aa  269  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  56.88 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  55 
 
 		 159 aa  191  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0561  dihydrofolate reductase  55.9 
 
 		 165 aa  190  6e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  54.66 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  51.55 
 
 		 161 aa  173  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  50.57 
 
 		 173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  51.18 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  53.74 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  57.86 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  50.91 
 
 		 167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  57.86 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  59.26 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  57.14 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  55.32 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  48.75 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 175 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  54.29 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  52.17 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  53.02 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  56.43 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  50.33 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  56.43 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  50.33 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  55.71 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  55.71 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 169 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  51.52 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 		 170 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  44.31 
 
 		 171 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 164 aa  144  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  42.77 
 
 		 161 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 170 aa  143  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  51.41 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 167 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 171 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 187 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  44.79 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 188 aa  134  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  42.41 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 172 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 209 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>