198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3632 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  66.54 
 
 		 784 aa  1102    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  66.54 
 
 		 784 aa  1102    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  69.75 
 
 		 750 aa  1132    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 799 aa  1658    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  72.22 
 
 		 807 aa  1233    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  66.67 
 
 		 784 aa  1105    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  67.05 
 
 		 786 aa  1115    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  66.29 
 
 		 784 aa  1096    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  67.3 
 
 		 786 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  69.62 
 
 		 750 aa  1130    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  74.94 
 
 		 799 aa  1269    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  94.26 
 
 		 801 aa  1580    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  66.54 
 
 		 784 aa  1102    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  66.54 
 
 		 784 aa  1102    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  43.98 
 
 		 781 aa  675    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  66.54 
 
 		 785 aa  1103    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  66.07 
 
 		 773 aa  1079    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  67.3 
 
 		 786 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  66.54 
 
 		 784 aa  1102    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  70.39 
 
 		 780 aa  1190    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  67.17 
 
 		 786 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  66.16 
 
 		 781 aa  1104    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  72.78 
 
 		 787 aa  1225    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  66.54 
 
 		 784 aa  1102    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  38.16 
 
 		 781 aa  525  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  38.44 
 
 		 781 aa  525  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  37.18 
 
 		 787 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  35.96 
 
 		 784 aa  472  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  34.17 
 
 		 764 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  34.45 
 
 		 773 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  33.98 
 
 		 774 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  34.54 
 
 		 766 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 773 aa  452  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  34.36 
 
 		 774 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  33.54 
 
 		 765 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  33.63 
 
 		 766 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  35.35 
 
 		 790 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  32.65 
 
 		 765 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  33.04 
 
 		 765 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  33.04 
 
 		 765 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  33.16 
 
 		 765 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  32.66 
 
 		 765 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  32.04 
 
 		 750 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  33.16 
 
 		 765 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  32.99 
 
 		 765 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  32.86 
 
 		 765 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  31.31 
 
 		 735 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  32.51 
 
 		 771 aa  405  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.9 
 
 		 924 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.69 
 
 		 922 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  29.07 
 
 		 738 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 938 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  28.61 
 
 		 839 aa  313  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  28.93 
 
 		 753 aa  310  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  28.45 
 
 		 839 aa  311  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  28.72 
 
 		 778 aa  310  8e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  29.78 
 
 		 932 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  29.48 
 
 		 813 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.01 
 
 		 905 aa  303  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  29.07 
 
 		 813 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  28.8 
 
 		 811 aa  299  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  29.2 
 
 		 935 aa  299  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  27.69 
 
 		 926 aa  297  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  27.06 
 
 		 826 aa  293  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  28.39 
 
 		 937 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  29.02 
 
 		 934 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  26.75 
 
 		 919 aa  286  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  27.55 
 
 		 824 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  28.59 
 
 		 813 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  27.13 
 
 		 728 aa  281  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  25.98 
 
 		 810 aa  280  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  28.31 
 
 		 860 aa  273  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  28.01 
 
 		 792 aa  272  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  27.41 
 
 		 757 aa  272  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  29.47 
 
 		 849 aa  270  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  28.14 
 
 		 792 aa  269  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  27.88 
 
 		 788 aa  265  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  27.86 
 
 		 836 aa  264  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  28.81 
 
 		 803 aa  263  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  27.32 
 
 		 787 aa  260  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  27.27 
 
 		 787 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  27.27 
 
 		 787 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 788 aa  260  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 		 787 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 		 787 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 		 787 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 		 787 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 		 761 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  28.65 
 
 		 751 aa  259  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  26.78 
 
 		 786 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  26.62 
 
 		 789 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  27.7 
 
 		 929 aa  253  8.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  27.04 
 
 		 786 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  26.9 
 
 		 786 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  28.26 
 
 		 819 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  26.49 
 
 		 786 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  26.49 
 
 		 786 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  26.83 
 
 		 776 aa  248  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  26.49 
 
 		 786 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  26.79 
 
 		 799 aa  247  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>