More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3593 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0136  cell division protein FtsW  82.01 
 
 
414 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3781  cell division protein FtsW  97.5 
 
 
400 aa  729    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0143  cell division protein FtsW  82.01 
 
 
414 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.247505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3593  cell division protein FtsW  100 
 
 
400 aa  797    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0609  cell division protein FtsW  92.25 
 
 
400 aa  710    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2919  cell division protein FtsW  86.5 
 
 
400 aa  681    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0139  cell division protein FtsW  82.01 
 
 
414 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.571731  hitchhiker  0.000000336901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0760  cell division protein FtsW  87.89 
 
 
400 aa  680    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682655  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3519  cell division protein FtsW  86.75 
 
 
400 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0635  cell division protein FtsW  81.49 
 
 
414 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.146996  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0139  cell division protein FtsW  82.01 
 
 
414 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.919378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0144  cell division protein FtsW  82.01 
 
 
414 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0378146  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3388  cell division protein FtsW  86.75 
 
 
400 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0647  cell division protein FtsW  91.5 
 
 
400 aa  714    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00090  integral membrane protein involved in stabilizing FstZ ring during cell division  79.69 
 
 
414 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3511  cell division protein FtsW  79.69 
 
 
414 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0095  cell division protein FtsW  79.69 
 
 
414 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.747639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0097  cell division protein FtsW  79.69 
 
 
414 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00089  hypothetical protein  79.69 
 
 
414 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0091  cell division protein FtsW  79.69 
 
 
414 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00890066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3568  cell division protein FtsW  79.69 
 
 
414 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0094  cell division protein FtsW  79.69 
 
 
414 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251291  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0082  cell division protein FtsW  79.43 
 
 
414 aa  614  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  64.03 
 
 
398 aa  472  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  62.02 
 
 
398 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  62.3 
 
 
398 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  56.96 
 
 
404 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  57.83 
 
 
400 aa  444  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  55.84 
 
 
403 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  60.66 
 
 
402 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  56.01 
 
 
403 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  55.7 
 
 
403 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  55.33 
 
 
403 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  55.33 
 
 
403 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4466  cell division protein FtsW  56.03 
 
 
437 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03259  cell division protein FtsW  60.16 
 
 
470 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  58.01 
 
 
410 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  55.78 
 
 
405 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0412  cell division protein FtsW  56.92 
 
 
403 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3520  cell division protein FtsW  59.03 
 
 
487 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0401  cell division protein FtsW  56.92 
 
 
403 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0400  cell division protein FtsW  56.92 
 
 
403 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0426  cell division protein FtsW  56.92 
 
 
403 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  53.81 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  52.82 
 
 
404 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  55.08 
 
 
404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  53.02 
 
 
406 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0357  cell division protein  51.22 
 
 
394 aa  371  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.891735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  46.8 
 
 
398 aa  318  9e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  47.65 
 
 
372 aa  318  9e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  47.37 
 
 
372 aa  316  4e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  45.05 
 
 
391 aa  315  6e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  45.05 
 
 
391 aa  315  7e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2674  cell division protein FtsW  44.57 
 
 
427 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3471  cell division protein FtsW  43.6 
 
 
425 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162796  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0768  cell division protein FtsW  46.78 
 
 
400 aa  305  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.626093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0485  cell division transmembrane protein, FtsW  43.32 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  42.6 
 
 
423 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  42.6 
 
 
423 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0487  cell division protein FtsW  42.52 
 
 
427 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564923  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3644  cell cycle protein  42.52 
 
 
427 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3129  cell cycle protein  43.87 
 
 
413 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0076  cell division protein FtsW  42.78 
 
 
427 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0462  cell division protein FtsW  42.52 
 
 
427 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0558  cell division protein FtsW  42.78 
 
 
427 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0529  cell division protein FtsW  42.52 
 
 
427 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704536  normal  0.739964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2191  cell cycle protein  45.55 
 
 
394 aa  298  8e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2837  cell division protein FtsW  41.73 
 
 
427 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202196  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  45.35 
 
 
399 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  45.35 
 
 
399 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2980  cell cycle protein  44.99 
 
 
413 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2845  cell division FtsW transmembrane protein  41.79 
 
 
413 aa  292  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0921  cell division protein FtsW  47.09 
 
 
402 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3526  cell division protein FtsW  41.73 
 
 
430 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1332  cell division protein FtsW  41.73 
 
 
430 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2552  cell division protein FtsW  41.73 
 
 
430 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2862  cell cycle protein, FtsW  45.26 
 
 
384 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00502116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3231  cell division protein FtsW  41.73 
 
 
430 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0473  cell division protein FtsW  41.73 
 
 
430 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3551  cell division protein FtsW  41.73 
 
 
430 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2092  cell division protein FtsW  45.48 
 
 
395 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3546  cell division protein FtsW  41.73 
 
 
462 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3499  cell cycle protein  39.95 
 
 
387 aa  289  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00851666  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3090  cell division protein FtsW  42.05 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.812659  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1117  cell division protein FtsW  40.94 
 
 
462 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2270  cell cycle protein  41.95 
 
 
392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.011941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2725  cell division protein FtsW  42.27 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4674  cell cycle protein  45.64 
 
 
405 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000737984  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0943  cell division protein FtsW  45.35 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0820  cell division protein FtsW  41.69 
 
 
427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.671328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2194  cell division protein FtsW  45.38 
 
 
401 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.689364  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0461  cell division protein FtsW  40.93 
 
 
430 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.216313  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  41.71 
 
 
386 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0521  cell division protein FtsW  42.93 
 
 
422 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1074  cell cycle protein  41.99 
 
 
420 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906686  normal  0.836068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2615  cell division protein FtsW  40.61 
 
 
397 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000584566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2202  cell division protein FtsW  43.26 
 
 
400 aa  279  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244408  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3418  cell division protein FtsW  41.53 
 
 
421 aa  278  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3426  cell cycle protein  42.97 
 
 
411 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4409  cell division protein FtsW  44.9 
 
 
404 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>