More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3538 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 294 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  98.98 
 
 		 294 aa  600  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  86.05 
 
 		 294 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  86.01 
 
 		 294 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1160  dihydrodipicolinate synthetase  52.74 
 
 		 296 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3408  dihydrodipicolinate synthetase  46.15 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.169511  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3053  dihydrodipicolinate synthetase  45.79 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  0.0327331 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3989  dihydrodipicolinate synthetase  43.2 
 
 		 296 aa  241  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  39.12 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  39.12 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  38.78 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  38.63 
 
 		 298 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  37.55 
 
 		 298 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  34.29 
 
 		 298 aa  175  9e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  36.11 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  37.04 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  35.56 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  34.36 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.09 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  34.85 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  35.16 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  34.77 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.99 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 290 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  35.13 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  35.93 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  35.93 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  32.49 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  34.6 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  34.6 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.19 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  35.47 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  34.43 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  34.07 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  34.07 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  34.43 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  34.43 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  34.43 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  34.43 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  34.43 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  34.43 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  34.43 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  35.93 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 294 aa  142  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  33.7 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  32.18 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 371 aa  138  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  34.93 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  32.18 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  26.87 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  34.84 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  26.87 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>