91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3518 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3518  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
145 aa  290  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  90.21 
 
 
143 aa  266  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3946  GCN5-related N-acetyltransferase  67.13 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.197235  normal  0.746328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  56.03 
 
 
148 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3075  GCN5-related N-acetyltransferase  56.85 
 
 
149 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  53.15 
 
 
155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4070  GCN5-related N-acetyltransferase  55.28 
 
 
149 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.989966  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3957  GCN5-related N-acetyltransferase  55.28 
 
 
149 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.762591  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1681  GCN5-related N-acetyltransferase  46.76 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.30352  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2015  acetyltransferase, GNAT family  46.76 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  48.48 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3274  GCN5-related N-acetyltransferase  48.03 
 
 
150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3106  GCN5-related N-acetyltransferase  47.79 
 
 
160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678979  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0062  GCN5-related N-acetyltransferase  45.53 
 
 
153 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2587  GCN5-related N-acetyltransferase  45.38 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1786  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
142 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2908  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
141 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4870  GCN5-related N-acetyltransferase  37.32 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2296  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
217 aa  90.5  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119831  normal  0.70533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21450  acetyltransferase (GNAT) family protein  41.84 
 
 
140 aa  76.6  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.464847 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3166  acetyltransferase, GNAT family  31.2 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0840877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2762  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2004  acetyltransferase, GNAT family  29.6 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.694453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2334  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3993  GCN5-related protein N-acetyltransferase  34.68 
 
 
150 aa  67  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2488  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4971  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1938  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.926851  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3927  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
179 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2117  acetyltransferase, GNAT family  26.43 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2171  acetyltransferase  27.61 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2185  acetyltransferase, GNAT family  26.47 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0646  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1939  acetyltransferase  28.1 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1901  acetyltransferase  26.47 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00182478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1891  acetyltransferase  26.77 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2086  acetyltransferase  28.1 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3229  acetyltransferase, GNAT family  30.63 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.324483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2560  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
158 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5019  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3544  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287849  normal  0.122011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18031  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
163 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.142661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4001  GCN5-related N-acetyltransferase  26.87 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
151 aa  50.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0380  acetyltransferase  29.36 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.335252  hitchhiker  0.000000351254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2076  acetyltransferase, GNAT family  28.83 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01129  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1505  GCN5-related N-acetyltransferase  25.6 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1261  putative acetyltransferase  39.24 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0041  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.875009  normal  0.791759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2003  putative acetyltransferase  37.97 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.408037 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2564  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4755  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.267052  normal  0.667871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1568  GCN5-related N-acetyltransferase  27.64 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.882937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  32.67 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20491  putatative acetyltransferase  33 
 
 
172 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0667747  normal  0.264372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09668  hypothetical protein  21.95 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5058  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153522  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1761  putatative acetyltransferase  30 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389085  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2063  putative acetyltransferase  36.71 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.297945  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1453  putative acetyltransferase  36.71 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0558082  normal  0.748817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
149 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5358  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
166 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
160 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0556  GCN5-related N-acetyltransferase  24.75 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0716622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1539  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09990  putative acetyltransferase  36.36 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175715  normal  0.714198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0975  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49336  predicted protein  29.17 
 
 
218 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3331  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.597755  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08239  N-acetyltransferase  33.33 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.576483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3783  GCN5-related N-acetyltransferase  36.76 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342216  hitchhiker  0.0000380368 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  25.69 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>