248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3332 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3332  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  100 
 
 		 394 aa  775    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4861  nucleoside transporter  81.98 
 
 		 394 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1544  Na+ dependent nucleoside transporter  76.14 
 
 		 394 aa  604  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3416  nucleoside transporter  73.35 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000564336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2965  nucleoside transporter  73.48 
 
 		 398 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1207  nucleoside transporter  74.37 
 
 		 393 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00208272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1313  nucleoside transporter  73.23 
 
 		 398 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2701  nucleoside transporter  73.6 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0555199  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2683  nucleoside transporter NupC  72 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000153474  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02302  nucleoside (except guanosine) transporter  72 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.189478  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1265  nucleoside transporter  72 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2544  nucleoside transporter NupC  72 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000306295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02263  hypothetical protein  72 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.179637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2761  nucleoside transporter NupC  72 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.246953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2927  nucleoside transporter  72.91 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0518898  normal  0.239717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2530  nucleoside transporter NupC  72 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1277  nucleoside transporter  72 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.875115  normal  0.0905888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1438  nucleoside transporter  71.83 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0187769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1326  nucleoside transporter NupC  71.83 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000589339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3624  nucleoside transporter NupC  72 
 
 		 400 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00341076  normal  0.575462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2773  nucleoside transporter NupC  72.75 
 
 		 400 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.571863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2643  nucleoside transporter NupC  73 
 
 		 400 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2552  nucleoside transporter NupC  72.5 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00708575  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2601  nucleoside transporter NupC  72.5 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2667  nucleoside transporter NupC  72.5 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3637  Na+ dependent nucleoside transporter  66.75 
 
 		 394 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0674  NupC family nucleoside transporter  57.14 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0733  nucleoside transporter, NupC family  56.89 
 
 		 392 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.998503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0573  NupC family nucleoside transporter  57.65 
 
 		 392 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0517  nucleoside permease  57.65 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0606  NupC family nucleoside transporter  57.65 
 
 		 392 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0644  nucleoside transporter, NupC family  57.4 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.617148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4694  nucleoside transporter, NupC family  57.65 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178149  hitchhiker  0.000000000152911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0662  nucleoside transporter, NupC family  57.4 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31194e-30 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0517  nucleoside permease  56.89 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0520  Na+ dependent nucleoside transporter  56.63 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3641  Na+ dependent nucleoside transporter  55.53 
 
 		 393 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0933275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3640  Na+ dependent nucleoside transporter  54.57 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5198  NupC family nucleoside transporter  56.65 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5213  nucleoside transporter, NupC family  56.65 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000156802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4922  NupC family nucleoside transporter  56.38 
 
 		 393 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000367634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4766  NupC family nucleoside transporter  56.65 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.81544e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4785  NupC family nucleoside transporter  56.65 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000762295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5298  NupC family nucleoside transporter  56.38 
 
 		 393 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000710562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4883  Na+ dependent nucleoside transporter  56.38 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000732708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5166  nucleoside transporter, NupC family  56.65 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19661e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5203  nucleoside transporter, NupC family  56.38 
 
 		 393 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000345335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5199  NupC family nucleoside transporter  56.53 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000293226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4923  NupC family nucleoside transporter  56.27 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000248626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4786  NupC family nucleoside transporter  56.27 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000304389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5299  NupC family nucleoside transporter  56.27 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000694938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4884  Na+ dependent nucleoside transporter  56.8 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000642278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4767  NupC family nucleoside transporter  56.27 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.53669e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5167  nucleoside transporter, NupC family  56.27 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5204  nucleoside transporter, NupC family  56 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000290265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5214  nucleoside transporter, NupC family  56 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000833528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0044  nucleoside transporter, NupC family  55.73 
 
 		 393 aa  421  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1753  nucleoside transporter  55.96 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1976  nucleoside transporter NupC  55.96 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000181124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1896  nucleoside transporter NupC  56.23 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000063998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2003  nucleoside transporter NupC  56.76 
 
 		 393 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000635472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1755  nucleoside transporter NupC  56.5 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0165255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1733  nucleoside transporter  56.5 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1704  nucleoside transporter  56.76 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00533341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1893  nucleoside transporter NupC  56.5 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00196927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3450  nucleoside transporter NupC  56.5 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00363674  hitchhiker  1.36656e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1928  nucleoside transporter NupC  56.23 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.80258e-46 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1492  NupC family nucleoside transporter  54.45 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0149107  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1281  pyrimidine nucleoside transporter  54.19 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00013711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0161  nucleoside permease NupC  53.35 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1150  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  52.31 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0678065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0557  Na+ dependent nucleoside transporter  52.32 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0543  Na+ dependent nucleoside transporter  52.32 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0303  Na+ dependent nucleoside transporter  43.24 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0296  Na+ dependent nucleoside transporter  43.24 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.589697  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0820  nucleoside permease  45.38 
 
 		 394 aa  322  9.000000000000001e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.890924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0317  NupC family nucleoside transporter  41.78 
 
 		 398 aa  275  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0576601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0300  nucleoside transporter  41.78 
 
 		 398 aa  275  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0304  nucleoside transporter  41.78 
 
 		 398 aa  275  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000825173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0332  NupC family nucleoside transporter  41.78 
 
 		 398 aa  275  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0364  nucleoside transporter, NupC family  41.78 
 
 		 398 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0379  nucleoside transporter, NupC family  40.81 
 
 		 398 aa  276  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.633762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4940  nucleoside transporter, NupC family  40.81 
 
 		 398 aa  276  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.386033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0312  Na+ dependent nucleoside transporter  41.41 
 
 		 398 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0310  Na+ dependent nucleoside transporter  40.05 
 
 		 398 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0362  NupC family nucleoside transporter  41.78 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0405  nucleoside transporter, NupC family  41.25 
 
 		 398 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.525323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2253  nucleoside transporter, NupC family  34.43 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.164569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2710  nucleoside transporter  34.18 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.166776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2787  nucleoside transporter  34.18 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.416184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3027  NupC family nucleoside transporter  33.67 
 
 		 397 aa  223  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3026  nucleoside transporter, NupC family  34.18 
 
 		 397 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.446251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2780  NupC family nucleoside transporter  34.18 
 
 		 397 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2729  nucleoside transporter  34.18 
 
 		 397 aa  222  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2991  NupC family nucleoside transporter  34.18 
 
 		 397 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2992  nucleoside transporter, NupC family  34.18 
 
 		 397 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2987  nucleoside transporter, NupC family  33.92 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000283568 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  32.25 
 
 		 417 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  32.62 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  31.27 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>