More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3331 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  84.2 
 
 		 512 aa  850    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  84.2 
 
 		 512 aa  850    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  62.03 
 
 		 512 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  83.6 
 
 		 512 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  84.4 
 
 		 512 aa  851    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  84.2 
 
 		 512 aa  850    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  62.03 
 
 		 512 aa  636    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3598  multidrug resistance protein Y  62.03 
 
 		 512 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0257273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  84.54 
 
 		 511 aa  882    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  84.2 
 
 		 512 aa  850    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  84.54 
 
 		 510 aa  878    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.54 
 
 		 511 aa  870    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  84.54 
 
 		 511 aa  882    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.37 
 
 		 515 aa  865    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  97.85 
 
 		 511 aa  980    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.54 
 
 		 511 aa  882    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.03 
 
 		 512 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  62.03 
 
 		 512 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  62.03 
 
 		 512 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  84.2 
 
 		 512 aa  850    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.2 
 
 		 512 aa  850    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  84 
 
 		 512 aa  868    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  83.8 
 
 		 512 aa  868    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  84 
 
 		 512 aa  868    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  83.3 
 
 		 515 aa  830    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  84.2 
 
 		 512 aa  850    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  83.4 
 
 		 512 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 511 aa  1028    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  85.43 
 
 		 513 aa  871    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02277  predicted multidrug efflux system  62.03 
 
 		 512 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02238  hypothetical protein  62.03 
 
 		 512 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.945599  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2504  multidrug resistance protein Y  61.83 
 
 		 512 aa  628  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0957152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  57.26 
 
 		 518 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.85 
 
 		 518 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.77 
 
 		 544 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.97 
 
 		 518 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.8 
 
 		 537 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.55 
 
 		 519 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.55 
 
 		 519 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.55 
 
 		 519 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.42 
 
 		 533 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.11 
 
 		 519 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.94 
 
 		 519 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.74 
 
 		 519 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.57 
 
 		 520 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.74 
 
 		 519 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.74 
 
 		 519 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  52.37 
 
 		 520 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.94 
 
 		 519 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.74 
 
 		 519 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.16 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.74 
 
 		 519 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.71 
 
 		 519 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.16 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.74 
 
 		 519 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.23 
 
 		 520 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.64 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.16 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.31 
 
 		 519 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.24 
 
 		 520 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.11 
 
 		 519 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.24 
 
 		 520 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.91 
 
 		 521 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.32 
 
 		 520 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  52.31 
 
 		 520 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.89 
 
 		 520 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.89 
 
 		 520 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.09 
 
 		 520 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.89 
 
 		 520 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.09 
 
 		 520 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.37 
 
 		 520 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.11 
 
 		 527 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.73 
 
 		 524 aa  524  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.31 
 
 		 520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.2 
 
 		 522 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.79 
 
 		 511 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.3 
 
 		 511 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.3 
 
 		 511 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.1 
 
 		 511 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.11 
 
 		 509 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.93 
 
 		 515 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  49.6 
 
 		 519 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  51.02 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.8 
 
 		 520 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.19 
 
 		 520 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  50.4 
 
 		 509 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.9 
 
 		 529 aa  497  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.51 
 
 		 512 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.22 
 
 		 577 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68140  drug efflux transporter  50.6 
 
 		 509 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000279343  decreased coverage  0.00567017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.79 
 
 		 543 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.4 
 
 		 520 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.31 
 
 		 521 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.24 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.64 
 
 		 517 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  48.79 
 
 		 525 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.66 
 
 		 517 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.03 
 
 		 522 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  49.48 
 
 		 531 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.31 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>