More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3293 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  100 
 
 
257 aa  531  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  92.58 
 
 
256 aa  474  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  72.27 
 
 
256 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  65.48 
 
 
256 aa  344  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  64.68 
 
 
256 aa  342  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  64.68 
 
 
256 aa  341  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  64.29 
 
 
256 aa  340  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  63.49 
 
 
256 aa  335  4e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  60.8 
 
 
256 aa  321  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  60.8 
 
 
256 aa  320  1e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  60.8 
 
 
256 aa  320  1e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  60.8 
 
 
256 aa  319  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  58.66 
 
 
255 aa  320  2e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  60.4 
 
 
256 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  73.66 
 
 
204 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  54.9 
 
 
255 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  72.58 
 
 
212 aa  296  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  56.5 
 
 
253 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  57.55 
 
 
254 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  56.63 
 
 
254 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  57.14 
 
 
254 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  56.22 
 
 
254 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  56.85 
 
 
251 aa  284  1e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  55.87 
 
 
250 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  74.85 
 
 
173 aa  278  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  55.82 
 
 
250 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  57.66 
 
 
251 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  57.66 
 
 
251 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  62.25 
 
 
207 aa  269  3e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  62.25 
 
 
207 aa  269  3e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  53.44 
 
 
256 aa  268  6e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  5.01952e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  55.47 
 
 
250 aa  268  6e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  57.26 
 
 
251 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  56.85 
 
 
251 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  56.85 
 
 
251 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  56.85 
 
 
251 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  56.85 
 
 
251 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.63 
 
 
250 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  61.76 
 
 
207 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  53.04 
 
 
250 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  51.82 
 
 
250 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  61.27 
 
 
207 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  52.65 
 
 
261 aa  263  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  51.42 
 
 
250 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  51.42 
 
 
250 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  60.29 
 
 
207 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  51.82 
 
 
250 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  49.02 
 
 
258 aa  258  5e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  51.42 
 
 
250 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  50.59 
 
 
259 aa  252  5e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  50.4 
 
 
261 aa  252  5e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  49.8 
 
 
259 aa  251  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  50.99 
 
 
259 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50.2 
 
 
254 aa  248  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  50.2 
 
 
254 aa  248  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  52.63 
 
 
250 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  52.63 
 
 
250 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  45.31 
 
 
256 aa  241  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  52.61 
 
 
258 aa  241  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  43.65 
 
 
264 aa  231  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  50 
 
 
261 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  46.03 
 
 
260 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  57.69 
 
 
187 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  45.78 
 
 
254 aa  214  1e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  31.2 
 
 
261 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.4 
 
 
261 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  30.8 
 
 
261 aa  146  4e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.33 
 
 
258 aa  146  4e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.33 
 
 
258 aa  146  4e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.8 
 
 
261 aa  145  8e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.4 
 
 
261 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.4 
 
 
261 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.08 
 
 
261 aa  140  2e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  32.27 
 
 
273 aa  139  5e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.95873e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
264 aa  136  3e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.51 
 
 
257 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  35.84 
 
 
253 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  32 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  39.5 
 
 
178 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
1002 aa  83.2  4e-15  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
1000 aa  82  8e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
209 aa  82  9e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  81.3  1e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
259 aa  81.6  1e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  38.93 
 
 
409 aa  81.6  1e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34 
 
 
277 aa  81.3  1e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  40.57 
 
 
251 aa  80.9  2e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 
280 aa  81.3  2e-14  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  26.19 
 
 
246 aa  80.9  2e-14  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.18 
 
 
249 aa  80.5  3e-14  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 
281 aa  79.7  4e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.66 
 
 
249 aa  79.3  5e-14  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.51 
 
 
263 aa  78.2  1e-13  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.18 
 
 
241 aa  78.2  1e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.55 
 
 
277 aa  78.6  1e-13  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  40 
 
 
262 aa  78.2  1e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  42.45 
 
 
265 aa  78.2  1e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.40908e-07  hitchhiker  4.3462e-08 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
211 aa  77.4  2e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
226 aa  77.4  2e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.29 
 
 
241 aa  76.6  3e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>