175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3252 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  54.93 
 
 		 606 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  93.37 
 
 		 588 aa  1154    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  54.93 
 
 		 606 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  54.9 
 
 		 590 aa  679    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  100 
 
 		 588 aa  1213    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  52.29 
 
 		 588 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  97.96 
 
 		 588 aa  1195    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  52.37 
 
 		 588 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  51.87 
 
 		 587 aa  613  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  51.1 
 
 		 589 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  46.88 
 
 		 588 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  46.78 
 
 		 588 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  46.71 
 
 		 588 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  45.08 
 
 		 588 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1108  type VI secretion protein, family  44.52 
 
 		 617 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1227  hypothetical protein  44.68 
 
 		 617 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.366123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0243  hypothetical protein  43.99 
 
 		 616 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.956418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0235  hypothetical protein  43.99 
 
 		 616 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0237  hypothetical protein  43.82 
 
 		 616 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  40.68 
 
 		 582 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  40.44 
 
 		 582 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  39.14 
 
 		 595 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  37.52 
 
 		 595 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  39.02 
 
 		 596 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  37.11 
 
 		 595 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1121  putative type VI secretion protein VasA  34.28 
 
 		 583 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0138508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  35.82 
 
 		 577 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0740  hypothetical protein  33.79 
 
 		 580 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0608  hypothetical protein  33.79 
 
 		 580 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0719  hypothetical protein  33.79 
 
 		 580 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2029  hypothetical protein  33.79 
 
 		 580 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1677  hypothetical protein  33.79 
 
 		 580 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0538  hypothetical protein  33.62 
 
 		 580 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2127  hypothetical protein  33.62 
 
 		 580 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43000  hypothetical protein  34.07 
 
 		 526 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5427  hypothetical protein  35.9 
 
 		 517 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0866  hypothetical protein  33.39 
 
 		 580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3313  hypothetical protein  33.79 
 
 		 576 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  31.39 
 
 		 604 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  32.01 
 
 		 606 aa  292  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  31.56 
 
 		 608 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  30.71 
 
 		 610 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2818  hypothetical protein  31.85 
 
 		 585 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  30.53 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  30.37 
 
 		 606 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  30.21 
 
 		 606 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.06 
 
 		 590 aa  269  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  31.51 
 
 		 611 aa  266  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.95 
 
 		 590 aa  263  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  29.66 
 
 		 606 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  31.02 
 
 		 587 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  31.02 
 
 		 587 aa  253  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  30.85 
 
 		 587 aa  253  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1800  hypothetical protein  30.27 
 
 		 584 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765675  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  30.85 
 
 		 587 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3245  type VI secretion protein  30.83 
 
 		 589 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  30.56 
 
 		 610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  30.64 
 
 		 611 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  28.53 
 
 		 609 aa  236  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.35 
 
 		 612 aa  236  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  30.46 
 
 		 611 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  30.48 
 
 		 616 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  30.25 
 
 		 611 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  30.08 
 
 		 611 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  30.08 
 
 		 611 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  30.08 
 
 		 611 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  30.08 
 
 		 611 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  30.85 
 
 		 625 aa  230  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  30.08 
 
 		 611 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  29.4 
 
 		 607 aa  226  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  30.62 
 
 		 612 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  31.58 
 
 		 612 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  30.92 
 
 		 612 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  30.92 
 
 		 612 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  30.92 
 
 		 612 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  30.92 
 
 		 612 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  30.31 
 
 		 597 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  30.31 
 
 		 597 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  29.77 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  30.35 
 
 		 623 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  29.17 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  29.17 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  29.17 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  29.17 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  30.49 
 
 		 589 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  30.59 
 
 		 597 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  29.17 
 
 		 623 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  29.17 
 
 		 623 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  29.8 
 
 		 586 aa  216  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  29.01 
 
 		 623 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  28.25 
 
 		 623 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  29.76 
 
 		 589 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.77 
 
 		 623 aa  208  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  28.53 
 
 		 619 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0021  hypothetical protein  25.75 
 
 		 589 aa  205  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.864029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  28.14 
 
 		 628 aa  204  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  28.16 
 
 		 619 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  28.09 
 
 		 619 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  28.55 
 
 		 605 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  28.28 
 
 		 620 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>